41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0344 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0344  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  100 
 
 		 61 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0701  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  63.64 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0194484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0165  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  50 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1052  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  49.12 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  53.06 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2359  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  55.32 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0712  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  49.09 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720002  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1791  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.71 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1276  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  56.52 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1364  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  60.47 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.540828 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0452  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  60 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0935391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1178  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.06 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4262  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.11 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1606  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.11 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0765964  normal  0.010544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1815  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  44.44 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2415  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5919  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48.94 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.662161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3580  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48.89 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3827  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48.89 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19940  cbb3-type cytochrome oxidase maturation protein  41.67 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225111  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2611  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.9 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38073  normal  0.51835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1156  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.14 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.0826721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1103  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.65 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0784477  normal  0.590624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1196  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.65 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1238  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.11 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1340  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.11 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1226  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.86 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.012112  normal  0.558991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2045  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.48 
 
 		 48 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00305022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0462  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.06 
 
 		 52 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2045  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  65.38 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0103953  normal  0.644275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1995  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.22 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.407314  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1275  signal peptide protein  43.48 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3784  hypothetical protein  65.38 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376969  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1874  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.62 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.308145  normal  0.762783 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1370  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  47.62 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.938434  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2042  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  41.3 
 
 		 48 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.589343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44450  hypothetical protein  65.38 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00324047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1795  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  41.67 
 
 		 49 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1137  hypothetical protein  36.21 
 
 		 55 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0106882  normal  0.952365 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0933  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  33.96 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177633  normal  0.669398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1929  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.24 
 
 		 54 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00573341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>