169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0289 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 406 aa  811    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  50.74 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  49.38 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  54.8 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  49.62 
 
 		 429 aa  362  8e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  51.02 
 
 		 413 aa  359  6e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  48 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  44.14 
 
 		 406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  45.9 
 
 		 399 aa  333  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  51 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  44.39 
 
 		 394 aa  275  9e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  42.89 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  47.4 
 
 		 410 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  37.01 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  42.29 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 		 404 aa  216  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  37.77 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  31.83 
 
 		 413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 		 274 aa  172  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 		 402 aa  135  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 397 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 422 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  23.87 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  26.74 
 
 		 399 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 407 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  24.15 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 404 aa  112  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  29.57 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  27.49 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  22.81 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  40.36 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 956 aa  96.3  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  28.4 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  28.15 
 
 		 402 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 		 691 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  35 
 
 		 700 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  37.9 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 691 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 		 703 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  30.4 
 
 		 443 aa  86.3  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 		 994 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 443 aa  86.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 		 691 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  34.08 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  37.24 
 
 		 1340 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  25.81 
 
 		 1119 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  24.78 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  27.89 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  24.09 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 		 683 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 1106 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  29.45 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0314  hypothetical protein  31.6 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  32.91 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  28.76 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  30.34 
 
 		 537 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>