142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0249 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  100 
 
 		 315 aa  632  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  24.77 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  27.49 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  24.46 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  28.95 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  32.47 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  26.86 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  24.76 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.76 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  26.21 
 
 		 312 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  26.21 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  25.89 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  26.21 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  28.46 
 
 		 360 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  31.51 
 
 		 360 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  28.46 
 
 		 360 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  27.67 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  30.33 
 
 		 433 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  28.57 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  25.34 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  25.57 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  25.71 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  25.98 
 
 		 359 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  26.9 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  28.47 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  25.54 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  22.61 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  28.9 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.46 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  25.5 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  26.51 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  24.6 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  22.93 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  25.73 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  25.56 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  29.02 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  25.96 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  23.78 
 
 		 313 aa  86.3  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  25.76 
 
 		 316 aa  85.9  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  27.76 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  26.56 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.15 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  27.44 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  25.65 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.15 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  24.68 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  27.4 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.33 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  26.05 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  25.46 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.46 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  30.4 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  27.34 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  27.57 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  26.77 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  25.08 
 
 		 579 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  25.16 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  23.27 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  24.04 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  28.5 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  25.87 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  25.13 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  19.64 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  24.61 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  28.04 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  23.78 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  23.2 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  24.13 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  26.99 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  29.69 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  24.62 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  23.64 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  24.62 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  26.67 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  26.33 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  27.1 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  23.6 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.39 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  25.71 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  25.77 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.78 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  23.74 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  24.54 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.06 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.06 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0466  Mammalian cell entry related domain protein  30.94 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  29.02 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.06 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.06 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.06 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.06 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.06 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.06 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  23.05 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.98 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  25.32 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  28.57 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  23.27 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  27.45 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  24.7 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>