More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0242 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
206 aa  426  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  74.26 
 
 
209 aa  325  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  74.37 
 
 
212 aa  322  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  72.68 
 
 
212 aa  320  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  73.13 
 
 
211 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  70.73 
 
 
209 aa  316  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  70.73 
 
 
209 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  70.87 
 
 
292 aa  315  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  70.87 
 
 
242 aa  315  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  70.73 
 
 
211 aa  315  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  70.87 
 
 
292 aa  315  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  71.78 
 
 
210 aa  315  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  70.73 
 
 
211 aa  315  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  70.87 
 
 
292 aa  315  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  70.87 
 
 
292 aa  315  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  70.87 
 
 
236 aa  315  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  70.87 
 
 
292 aa  315  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  70.73 
 
 
211 aa  315  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  73.47 
 
 
209 aa  315  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  72.08 
 
 
258 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  68.34 
 
 
205 aa  301  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  70.16 
 
 
234 aa  292  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  70.83 
 
 
212 aa  289  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  63.98 
 
 
222 aa  267  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  64.48 
 
 
203 aa  261  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  65.03 
 
 
203 aa  260  8e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  64.48 
 
 
203 aa  257  7e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  63.39 
 
 
190 aa  255  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  63.74 
 
 
197 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  59.07 
 
 
206 aa  250  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 
205 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  60.99 
 
 
206 aa  242  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  60.33 
 
 
190 aa  242  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  61.24 
 
 
200 aa  238  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  61.45 
 
 
192 aa  236  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  57.84 
 
 
204 aa  235  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  60 
 
 
211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  56.45 
 
 
213 aa  234  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  57.53 
 
 
241 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  56.02 
 
 
222 aa  232  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  55.79 
 
 
272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  55.5 
 
 
219 aa  231  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  60.23 
 
 
210 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  57.45 
 
 
213 aa  230  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 
269 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 
213 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 
269 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 
234 aa  229  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 
269 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  54.97 
 
 
219 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  56.76 
 
 
201 aa  228  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  56.61 
 
 
234 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  56.32 
 
 
232 aa  227  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  52.88 
 
 
242 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  54.01 
 
 
213 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  56.84 
 
 
205 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  53.23 
 
 
213 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  55.44 
 
 
229 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  54.92 
 
 
229 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  54.4 
 
 
229 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  52.04 
 
 
213 aa  223  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 
204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  55.14 
 
 
204 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
206 aa  211  5.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  54.4 
 
 
225 aa  201  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  53.3 
 
 
226 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  50.79 
 
 
216 aa  197  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  48.45 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 
189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  49.48 
 
 
239 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
213 aa  195  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  49.48 
 
 
239 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  47.72 
 
 
270 aa  194  5.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  54.4 
 
 
190 aa  194  9e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  51.65 
 
 
187 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  55.25 
 
 
206 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  52.46 
 
 
188 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  47.59 
 
 
235 aa  193  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  48.4 
 
 
247 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  54.14 
 
 
220 aa  192  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  48.98 
 
 
223 aa  192  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 
193 aa  191  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  52.75 
 
 
185 aa  191  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  52.75 
 
 
186 aa  191  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  50.77 
 
 
199 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  53.63 
 
 
198 aa  190  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  47.94 
 
 
227 aa  189  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 
218 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  46.45 
 
 
243 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  51.12 
 
 
212 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  55 
 
 
257 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 
222 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  51.09 
 
 
188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  47.69 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  51.85 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  47.69 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  50.82 
 
 
224 aa  188  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 
223 aa  188  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  46.45 
 
 
190 aa  188  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>