More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0210 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0210  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  100 
 
 
544 aa  1104    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.189837 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0255  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  48.21 
 
 
577 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.537615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0227  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  48.73 
 
 
568 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.507724  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1575  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  48.73 
 
 
587 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  47.39 
 
 
690 aa  502  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2656  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  48.04 
 
 
691 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1856  sulfate adenylyltransferase  46.86 
 
 
578 aa  498  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0612  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  48.2 
 
 
572 aa  495  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.398101  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1013  sulfate adenylyltransferase  46.45 
 
 
570 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2034  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  46.28 
 
 
571 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000871956  decreased coverage  0.0000299137 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0714  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  39.31 
 
 
585 aa  406  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0818  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  39.48 
 
 
553 aa  405  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4308  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  41.61 
 
 
569 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3336  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  41.86 
 
 
578 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442858 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04769  Sulfate adenylyltransferase (EC 2.7.7.4)(Sulfate adenylate transferase)(SAT)(ATP-sulfurylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12555]  39.23 
 
 
574 aa  385  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1550  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  40.74 
 
 
569 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03560  phosphoadenosine-phosphosulfate synthase (PAPS) bifunctional enzyme, putative  34.37 
 
 
581 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.163154  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1573  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.33 
 
 
582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1021  adenylylsulfate kinase  42.69 
 
 
495 aa  327  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4172  adenylylsulfate kinase  41.93 
 
 
508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3792  adenylylsulfate kinase  41.06 
 
 
508 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00830426  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0696  Sulfate adenylyltransferase., Adenylyl-sulfate kinase  36.21 
 
 
557 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0250735  unclonable  0.000000000138306 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0539  sulfate adenylyltransferase, putative/adenylylsulfate kinase  36.21 
 
 
557 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5171  adenylylsulfate kinase  36.92 
 
 
606 aa  279  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0533144  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0065  adenylylsulfate kinase  38.89 
 
 
527 aa  276  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5804  adenylylsulfate kinase  37.23 
 
 
509 aa  269  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0425  adenylylsulfate kinase  38.58 
 
 
493 aa  261  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1339  adenylylsulfate kinase  57.35 
 
 
506 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.881911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8587  Adenylylsulfate kinase and related kinase-like protein  62.64 
 
 
409 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.941247  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3137  adenylylsulfate kinase  61.54 
 
 
405 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.447276  normal  0.113923 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  56.99 
 
 
670 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18790  adenylylsulfate kinase ApsK  60.82 
 
 
376 aa  209  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75451  Sulfate adenylyltransferase (Sulfate adenylate transferase) (SAT) (ATP-sulfurylase)  29.82 
 
 
523 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20752  normal  0.0971418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1075  adenylylsulfate kinase  57.49 
 
 
200 aa  189  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0277861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22650  Adenylyl-sulfate kinase  50.28 
 
 
185 aa  183  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1923  adenylylsulfate kinase  50.57 
 
 
175 aa  183  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.650575  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1747  adenylylsulfate kinase  54.55 
 
 
184 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0038  adenylylsulfate kinase  52.81 
 
 
185 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1619  adenylylsulfate kinase  54.65 
 
 
229 aa  174  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3998  adenylylsulfate kinase  51.12 
 
 
181 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4040  adenylylsulfate kinase  51.12 
 
 
181 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212019  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0967  adenylylsulfate kinase  51.37 
 
 
189 aa  170  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2826  adenylylsulfate kinase  49.16 
 
 
176 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00115262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3187  adenylylsulfate kinase  51.96 
 
 
202 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0460618 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2345  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  51.45 
 
 
638 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0939  adenylylsulfate kinase  48.3 
 
 
208 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2355  adenylylsulfate kinase  50.84 
 
 
192 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1408  adenylylsulfate kinase  50.28 
 
 
181 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3968  adenylylsulfate kinase  43.89 
 
 
193 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.267208  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1532  sulfate adenylyltransferase, large subunit  51.22 
 
 
647 aa  157  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2100  adenylylsulfate kinase  49.42 
 
 
214 aa  156  7e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2420  adenylylsulfate kinase  46.45 
 
 
214 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01861  adenylylsulfate kinase  41.97 
 
 
207 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2204  adenylylsulfate kinase  50.27 
 
 
203 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3831  adenylyl-sulfate kinase  46.46 
 
 
208 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000161314  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01841  adenylylsulfate kinase  42.49 
 
 
207 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3184  adenylylsulfate kinase  52.1 
 
 
207 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1291  adenylylsulfate kinase  46.7 
 
 
203 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2185  adenylylsulfate kinase  45.93 
 
 
199 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01831  adenylylsulfate kinase  43.16 
 
 
217 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.573546  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0168  adenylylsulfate kinase  42.78 
 
 
211 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1500  adenylylsulfate kinase  47.98 
 
 
198 aa  152  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1642  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), adenylyl-sulfate kinase  49.15 
 
 
462 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0313  adenylylsulfate kinase  46.33 
 
 
203 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2576  adenylylsulfate kinase  48.88 
 
 
220 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1305  adenylylsulfate kinase  44.63 
 
 
197 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2482  adenylylsulfate kinase  46.93 
 
 
212 aa  150  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.288285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1332  adenylylsulfate kinase  46.51 
 
 
197 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1442  adenylylsulfate kinase  46.51 
 
 
197 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1514  adenylylsulfate kinase  46.51 
 
 
197 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000229121 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3318  OmpA/MotB domain protein  49.13 
 
 
178 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.044435  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0666  adenylylsulfate kinase  52.98 
 
 
205 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1478  adenylylsulfate kinase  44.63 
 
 
197 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0411  adenylylsulfate kinase  43.72 
 
 
201 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4087  adenylylsulfate kinase  45.2 
 
 
212 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2888  adenylylsulfate kinase  48.04 
 
 
198 aa  148  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27091  adenylylsulfate kinase  44.57 
 
 
227 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01194  Adenylyl-sulfate kinase (EC 2.7.1.25)(Adenosine-5'-phosphosulfate kinase)(APS kinase)(ATP adenosine-5'-phosphosulfate 3'-phosphotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92203]  45.16 
 
 
206 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2622  adenylylsulfate kinase  43.98 
 
 
199 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0591419  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2186  sulfate adenylyltransferase  27.23 
 
 
392 aa  147  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1546  adenylylsulfate kinase  44.07 
 
 
197 aa  147  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0712  adenylyl-sulfate kinase  42.94 
 
 
201 aa  147  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000090997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0758  sulfate adenylyltransferase  29.92 
 
 
391 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  46.49 
 
 
633 aa  147  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4134  adenylylsulfate kinase  44.89 
 
 
181 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000428078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1758  Adenylyl-sulfate kinase  45.71 
 
 
179 aa  146  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916937  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1584  adenylylsulfate kinase  44.07 
 
 
197 aa  146  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1306  adenylylsulfate kinase  44.07 
 
 
197 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0858  adenylylsulfate kinase  45.98 
 
 
210 aa  146  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1346  adenylyl-sulfate kinase  44.63 
 
 
197 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0334  adenylyl-sulfate kinase  46.39 
 
 
195 aa  146  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  48.21 
 
 
638 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1862  adenylylsulfate kinase  45.66 
 
 
208 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310492  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3866  adenylylsulfate kinase  43.5 
 
 
203 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0962  adenylylsulfate kinase  50 
 
 
205 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4378  adenylylsulfate kinase  49.19 
 
 
195 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6392  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  48.48 
 
 
640 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3342  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  48.81 
 
 
640 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.914743  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2481  adenylylsulfate kinase  46.2 
 
 
179 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1650  adenylylsulfate kinase  43.02 
 
 
198 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>