More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0145 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0145  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 		 249 aa  500  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  29.69 
 
 		 295 aa  118  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  40.83 
 
 		 1402 aa  105  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  45.32 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  46.83 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  46.43 
 
 		 961 aa  98.2  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  43.33 
 
 		 448 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  47.32 
 
 		 393 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  44 
 
 		 359 aa  96.3  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  41.73 
 
 		 489 aa  95.9  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.93 
 
 		 831 aa  95.1  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  43.48 
 
 		 181 aa  95.1  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  41.59 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  44.07 
 
 		 731 aa  93.6  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.32 
 
 		 528 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.31 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  41.38 
 
 		 789 aa  92.4  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  40.14 
 
 		 303 aa  92.4  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  41.53 
 
 		 293 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.79 
 
 		 318 aa  91.7  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  39.1 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  41.59 
 
 		 684 aa  90.5  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.88 
 
 		 1110 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  39.16 
 
 		 1493 aa  90.9  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  47.75 
 
 		 380 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 416 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  41.18 
 
 		 305 aa  89.7  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  39.22 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  41.38 
 
 		 490 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  40.18 
 
 		 2413 aa  89  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  41.38 
 
 		 490 aa  89  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  39.61 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  41.98 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.16 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  37.76 
 
 		 329 aa  88.2  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  37.88 
 
 		 913 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  34.12 
 
 		 763 aa  87.4  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  32.74 
 
 		 1059 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.36 
 
 		 1012 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  31.67 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  37.59 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  34.78 
 
 		 817 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  40.18 
 
 		 185 aa  86.7  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.9 
 
 		 425 aa  86.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  44.25 
 
 		 482 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  31.49 
 
 		 1105 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.62 
 
 		 865 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  43.86 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  39.42 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  45.77 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  43.65 
 
 		 552 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.43 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  45.61 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  31.06 
 
 		 1134 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  44.23 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  43.36 
 
 		 1877 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  40.5 
 
 		 1037 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1002 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 976 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  36 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  40.48 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.5 
 
 		 523 aa  83.2  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.83 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  33.33 
 
 		 978 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  34.56 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  38.4 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.84 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  41.96 
 
 		 557 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  36.28 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  38.02 
 
 		 839 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  31.68 
 
 		 1086 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.21 
 
 		 1196 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  38.27 
 
 		 839 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.24 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  35.54 
 
 		 850 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.73 
 
 		 1263 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  36.43 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  36.43 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.16 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  36.43 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  36.43 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  32.32 
 
 		 172 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.59 
 
 		 1261 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  41.13 
 
 		 586 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  33.86 
 
 		 1475 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.89 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.95 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  38.89 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.59 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  31.77 
 
 		 1160 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  44.44 
 
 		 940 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  38.79 
 
 		 536 aa  76.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  37.59 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  38.21 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  38.21 
 
 		 838 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  33.96 
 
 		 438 aa  75.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  41.54 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  37.5 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>