More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0127 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  100 
 
 		 415 aa  835    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  35.09 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  34.55 
 
 		 365 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  33.07 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  31.96 
 
 		 363 aa  139  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  30.75 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  29.76 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  30.18 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  29.55 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  28.7 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  33.15 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  30.92 
 
 		 468 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  30.42 
 
 		 359 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  29.91 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  29.75 
 
 		 466 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  29.45 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  29.38 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  31.32 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  46.79 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 239 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  52.88 
 
 		 264 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1055  outer membrane protein  38.86 
 
 		 228 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  44.78 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  45.16 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  47.27 
 
 		 230 aa  107  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  46.85 
 
 		 244 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  51.92 
 
 		 239 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.13 
 
 		 240 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  46.36 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  48.15 
 
 		 224 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  45.24 
 
 		 166 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 218 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  52.94 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  49.02 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  54.9 
 
 		 213 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  51.49 
 
 		 330 aa  100  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44.55 
 
 		 212 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.95 
 
 		 294 aa  98.2  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  46.43 
 
 		 224 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  44.26 
 
 		 233 aa  97.4  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.59 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 237 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 459 aa  97.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  26.67 
 
 		 454 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  29.39 
 
 		 367 aa  97.1  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  48.6 
 
 		 266 aa  97.1  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  33.2 
 
 		 337 aa  97.1  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 537 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  44.74 
 
 		 226 aa  96.3  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  46.6 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 		 671 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  32.42 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  43.64 
 
 		 294 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  41.6 
 
 		 222 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  49.5 
 
 		 334 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  28.73 
 
 		 333 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  44.07 
 
 		 227 aa  94.4  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  45.19 
 
 		 707 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  36.29 
 
 		 656 aa  94  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.15 
 
 		 221 aa  93.6  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  44.17 
 
 		 209 aa  93.2  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  32.1 
 
 		 337 aa  93.2  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  29.11 
 
 		 466 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 296 aa  92.8  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.6 
 
 		 205 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 222 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  41.67 
 
 		 209 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 623 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  31.88 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 498 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  44.66 
 
 		 321 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  28.57 
 
 		 320 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  45.95 
 
 		 228 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  28.79 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  45.95 
 
 		 228 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  45.95 
 
 		 228 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  40.94 
 
 		 207 aa  90.9  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  43.48 
 
 		 286 aa  90.5  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  42.4 
 
 		 223 aa  90.1  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 		 227 aa  90.1  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  38.33 
 
 		 509 aa  90.1  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  32.92 
 
 		 505 aa  90.1  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 219 aa  89.7  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  41.94 
 
 		 1755 aa  89.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 209 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  41.28 
 
 		 640 aa  89.7  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 445 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  40.74 
 
 		 215 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  40.74 
 
 		 215 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  44.55 
 
 		 225 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  40.74 
 
 		 215 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 218 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 218 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  38.4 
 
 		 222 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  40.74 
 
 		 215 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  41.03 
 
 		 217 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 537 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  40.74 
 
 		 215 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 		 215 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>