221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0100 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  100 
 
 		 546 aa  1102    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  47.04 
 
 		 790 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  45.2 
 
 		 791 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  38.49 
 
 		 824 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 		 790 aa  256  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  31.74 
 
 		 582 aa  252  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  28.35 
 
 		 484 aa  166  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  27.97 
 
 		 484 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  27.97 
 
 		 484 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  25.29 
 
 		 488 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  27.97 
 
 		 484 aa  163  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  27 
 
 		 485 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  27.81 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  27.86 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  27.47 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  23.81 
 
 		 477 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  27.34 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  26.26 
 
 		 482 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  31.18 
 
 		 485 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  30.11 
 
 		 480 aa  124  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  31.18 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  37.77 
 
 		 480 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  34.45 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  34.45 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  25.25 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  24.8 
 
 		 491 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  33.97 
 
 		 502 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  33.97 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  33.97 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  25.25 
 
 		 488 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  26.36 
 
 		 491 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  25.96 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  25.05 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  32.89 
 
 		 484 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  24.85 
 
 		 488 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  34.29 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  30.7 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2971  serine/threonine protein kinase-like protein  28.89 
 
 		 586 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  23.51 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  33.16 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  31.49 
 
 		 489 aa  99.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  34.34 
 
 		 466 aa  99  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  30.41 
 
 		 494 aa  94.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2804  serine/threonine protein kinase  24.57 
 
 		 598 aa  93.2  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.67 
 
 		 290 aa  90.5  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.66 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  27.1 
 
 		 284 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 284 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  26.94 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  25.75 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  26.8 
 
 		 275 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.12 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  21.99 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  21.78 
 
 		 297 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  27.08 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.08 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  27.08 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  21.83 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.48 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  24.75 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  21.48 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  26.98 
 
 		 280 aa  73.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  26.56 
 
 		 274 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 		 285 aa  73.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 280 aa  73.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  23.96 
 
 		 299 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  29.13 
 
 		 277 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  22.09 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  23.44 
 
 		 299 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  23.32 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  25.71 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  28.22 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  25.94 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  25.6 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.22 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  23.74 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.22 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.22 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.09 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  22.84 
 
 		 284 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  23.44 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  28.45 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  23.27 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  23.31 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  24.26 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  23.3 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  21.74 
 
 		 282 aa  67  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  24.39 
 
 		 298 aa  67  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  23.3 
 
 		 467 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 		 378 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  23.3 
 
 		 467 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  23.95 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  23.42 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>