More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0099 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0099  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 342 aa  704    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.76 
 
 		 340 aa  490  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250219 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2662  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.04 
 
 		 341 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5374  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:nucleotide sugar epimerase  67.82 
 
 		 377 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.2 
 
 		 350 aa  478  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.08 
 
 		 362 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3189  polysaccharide biosynthesis protein  66.67 
 
 		 340 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001772  UDP-glucose 4-epimerase  66.57 
 
 		 340 aa  475  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.76 
 
 		 357 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.55139  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.28 
 
 		 342 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.28 
 
 		 340 aa  461  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3996  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.48 
 
 		 369 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0358  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  64.22 
 
 		 341 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.16 
 
 		 339 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.863846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.07 
 
 		 343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.5 
 
 		 342 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0651  NAD-dependent epimerase  64.52 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.562081  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.74 
 
 		 344 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2324  VI polysaccharide biosynthesis protein vipB/tviC  61.54 
 
 		 343 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29920  NAD-dependent epimerase protein  60.74 
 
 		 367 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.31 
 
 		 343 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.06 
 
 		 342 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.86 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5210  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.23 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.18 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.14 
 
 		 368 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.66 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.81 
 
 		 312 aa  292  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.9 
 
 		 313 aa  281  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  44.65 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.31 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.5 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.96 
 
 		 310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.28 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.39 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.51 
 
 		 304 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  42.28 
 
 		 308 aa  260  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.88 
 
 		 311 aa  252  6e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.44 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.99 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.76 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.34 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.34 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.34 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 		 310 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.82 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 		 310 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.26 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 		 309 aa  189  8e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.17 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.17 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.89 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 		 306 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 		 316 aa  183  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 		 302 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.02 
 
 		 314 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.99 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.73 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.39 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.96 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.31 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 311 aa  176  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.76 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  35.26 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.84 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 		 329 aa  169  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.24 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.1 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 		 305 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.83 
 
 		 316 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 		 310 aa  166  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>