106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0082 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  603  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  32.15 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  33.33 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  33.44 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  34.56 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  32.44 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  36.42 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  32.02 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.62 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  28.63 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  29.03 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  26.94 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  26.13 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  25.83 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.43 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.59 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  28 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  25.51 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  25.4 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  28.32 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  28.17 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.9 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  29.81 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.88 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  25.4 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  25.24 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  29.49 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  30.58 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  30.43 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.59 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  28.38 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  28.51 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  26.52 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  27.61 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  27.19 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  23.51 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.62 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  27.56 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.39 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.07 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.96 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  24.88 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  32.31 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  25.27 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  26.52 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  23.32 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  27.11 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.69 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  23.29 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  28.93 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  23.61 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  23.53 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  30.87 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  26.95 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  28.9 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  23.68 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  28.3 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  28.92 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  30.68 
 
 		 308 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  26.67 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0478  permease  27.51 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.07 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  26.07 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  29.7 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  28.18 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  29.65 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  27.75 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  28.16 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  27.88 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  29.65 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  25.33 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  27.48 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  27.67 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  29.26 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  28.7 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  31.8 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  29.83 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  32.43 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  30.61 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  28.7 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  29.03 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  27.52 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  31.72 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  33.83 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  31.98 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  30.18 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>