117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0074 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  680    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 348 aa  295  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.23 
 
 		 348 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.54 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  42.11 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.2 
 
 		 345 aa  272  7e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  42.46 
 
 		 331 aa  255  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.87 
 
 		 349 aa  255  9e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.24 
 
 		 346 aa  241  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.2 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 323 aa  238  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.15 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.38 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.79 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.03 
 
 		 337 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.77 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.02 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  34.86 
 
 		 769 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 351 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  29 
 
 		 337 aa  166  8e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.48 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 178 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  30.45 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 166 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  48.99 
 
 		 150 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  44.23 
 
 		 161 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  44.24 
 
 		 174 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  48.32 
 
 		 150 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.23 
 
 		 160 aa  139  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 160 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  44.24 
 
 		 174 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 158 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  44.72 
 
 		 171 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 154 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 166 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 151 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  44.1 
 
 		 171 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 155 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 159 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 173 aa  126  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 160 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.4 
 
 		 189 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 160 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 152 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 158 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 161 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 157 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 		 176 aa  116  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 159 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 		 166 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2492  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 157 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  38.4 
 
 		 183 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.38 
 
 		 160 aa  110  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 182 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 172 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 150 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 162 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 160 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.34 
 
 		 161 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 166 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 155 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 		 152 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 173 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 173 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  34.97 
 
 		 170 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0614  putative transcriptional regulator  40.14 
 
 		 147 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 156 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06690  putative transcriptional regulator  39.46 
 
 		 147 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0225881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 156 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 		 170 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 160 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 159 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 165 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 156 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0073  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 147 aa  99.8  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.302073  normal  0.744258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3268  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 152 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.573654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3175  nitrite reductase heme biosynthesis G  38.06 
 
 		 149 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1446  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 163 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.855842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 153 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 162 aa  96.3  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 164 aa  93.2  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 156 aa  93.2  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 155 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 165 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2081  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 149 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566316  normal  0.275605 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>