More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0069 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0069  arginase  100 
 
 
301 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  50.18 
 
 
309 aa  248  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  49.13 
 
 
315 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  43.49 
 
 
306 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  47.2 
 
 
309 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  46.85 
 
 
309 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  47.2 
 
 
309 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  37.8 
 
 
300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  38.1 
 
 
299 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  43.23 
 
 
299 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  43.78 
 
 
299 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  36.49 
 
 
298 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  35.86 
 
 
297 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  34.13 
 
 
297 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  34.13 
 
 
297 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  34.13 
 
 
297 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  34.47 
 
 
297 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  34.47 
 
 
297 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  38.5 
 
 
297 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  34.13 
 
 
297 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  34.13 
 
 
297 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  34.13 
 
 
297 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  34.13 
 
 
297 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  34.13 
 
 
297 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  36.21 
 
 
302 aa  155  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  32.54 
 
 
301 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  41.12 
 
 
301 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  35.91 
 
 
319 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  36.67 
 
 
306 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  36.51 
 
 
321 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  42.72 
 
 
298 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  36.7 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  43.98 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  39.53 
 
 
315 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  37.04 
 
 
306 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  35.81 
 
 
302 aa  143  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  34.46 
 
 
302 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  38.26 
 
 
310 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  30.74 
 
 
302 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  36.2 
 
 
311 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  30.74 
 
 
302 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  34.69 
 
 
304 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  42.93 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  35.46 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  35.91 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  41.4 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  36.96 
 
 
306 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  39.11 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  37.44 
 
 
321 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  40 
 
 
307 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  35.27 
 
 
282 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  34 
 
 
305 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  40.93 
 
 
296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  34.92 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  39.46 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  32.77 
 
 
304 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  35.39 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  33.56 
 
 
307 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  36 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  35.93 
 
 
308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.06 
 
 
316 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  35.89 
 
 
398 aa  125  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  33.45 
 
 
307 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  36.13 
 
 
309 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  38.99 
 
 
308 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  30.74 
 
 
314 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  37.13 
 
 
306 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  34.84 
 
 
322 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.74 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  34.03 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  36.36 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  38.19 
 
 
309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  36.87 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  36.36 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  35.69 
 
 
318 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  32.92 
 
 
324 aa  119  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  39.9 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  35.82 
 
 
310 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  32.07 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  34.62 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  35.11 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  35.96 
 
 
308 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  35.74 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  30.84 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  35.62 
 
 
308 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27 
 
 
319 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  34.62 
 
 
301 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  28.52 
 
 
317 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  30.14 
 
 
309 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  35 
 
 
306 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  32.09 
 
 
331 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  29.93 
 
 
328 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  33.99 
 
 
327 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  32.24 
 
 
328 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  32.53 
 
 
345 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  32.53 
 
 
345 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  32.18 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  31.51 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3987  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.57 
 
 
395 aa  92.4  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  31.33 
 
 
378 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>