65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0062 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0062  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.521251  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0125  hypothetical protein  68.38 
 
 
119 aa  169  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1220  hypothetical protein  60 
 
 
124 aa  156  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2396  hypothetical protein  58.73 
 
 
130 aa  152  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0142528  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1242  Protein of unknown function DUF2237  60.83 
 
 
124 aa  152  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0254718  normal  0.990114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2707  hypothetical protein  61.34 
 
 
128 aa  151  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2456  hypothetical protein  55.65 
 
 
124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3653  hypothetical protein  56.67 
 
 
124 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000473642  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4893  Protein of unknown function DUF2237  59.17 
 
 
135 aa  148  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1928  hypothetical protein  58.97 
 
 
118 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0221978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0685  hypothetical protein  55.37 
 
 
122 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5501  Protein of unknown function DUF2237  58.33 
 
 
122 aa  147  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.987798 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0828  hypothetical protein  56.67 
 
 
122 aa  146  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4999  hypothetical protein  60.68 
 
 
126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3740  hypothetical protein  56 
 
 
133 aa  142  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0832367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2959  hypothetical protein  59.83 
 
 
136 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5045  hypothetical protein  54.47 
 
 
130 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.638609  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5338  hypothetical protein  54.47 
 
 
130 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4957  hypothetical protein  54.47 
 
 
130 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1812  hypothetical protein  55.17 
 
 
128 aa  141  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0739219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2585  Protein of unknown function DUF2237  55.91 
 
 
129 aa  140  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406213  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1977  hypothetical protein  54.03 
 
 
124 aa  140  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3279  hypothetical protein  55 
 
 
124 aa  138  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3590  hypothetical protein  59.13 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0467  hypothetical protein  58.12 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1932  hypothetical protein  55.74 
 
 
126 aa  136  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal  0.599919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2412  hypothetical protein  54.24 
 
 
124 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0946  hypothetical protein  56 
 
 
132 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541769  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1352  hypothetical protein  56.9 
 
 
131 aa  135  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.412506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2023  hypothetical protein  54.31 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.616879  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3433  Protein of unknown function DUF2237  51.15 
 
 
135 aa  134  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1262  hypothetical protein  55.83 
 
 
124 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0643  hypothetical protein  51.26 
 
 
129 aa  134  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1527  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0175588  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1530  hypothetical protein  48.74 
 
 
125 aa  133  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.615056  normal  0.187499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1957  hypothetical protein  55.65 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.885386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2962  hypothetical protein  57.26 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3309  hypothetical protein  55.75 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0675  hypothetical protein  53.04 
 
 
129 aa  131  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2475  hypothetical protein  53.85 
 
 
148 aa  130  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1300  hypothetical protein  56.78 
 
 
123 aa  130  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0841  Protein of unknown function DUF2237  56.41 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5781  hypothetical protein  52.07 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00658  hypothetical protein  54.62 
 
 
121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08891  hypothetical protein  50.44 
 
 
126 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0835358  hitchhiker  0.00000698195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3888  hypothetical protein  56.52 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.99791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1049  hypothetical protein  52.5 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3584  hypothetical protein  54.17 
 
 
124 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.606008  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3269  hypothetical protein  54.17 
 
 
123 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.130768 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1126  hypothetical protein  52.63 
 
 
149 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164589  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0895  hypothetical protein  49.61 
 
 
129 aa  122  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0352424  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3965  hypothetical protein  48.33 
 
 
125 aa  121  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517461  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1408  Protein of unknown function DUF2237  50.82 
 
 
179 aa  120  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1528  hypothetical protein  48.25 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.808654  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34675  predicted protein  49.19 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.675349  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01011  hypothetical protein  53.04 
 
 
120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.889214  normal  0.906931 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09571  hypothetical protein  45 
 
 
128 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.665761  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11601  hypothetical protein  47.83 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0550185 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09841  hypothetical protein  43.1 
 
 
127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0853577  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0925  hypothetical protein  43.1 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0162536  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09861  hypothetical protein  43.1 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1402  hypothetical protein  51.3 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1564  hypothetical protein  43.97 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1392  hypothetical protein  51.9 
 
 
83 aa  90.5  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13777  hypothetical protein  53.33 
 
 
70 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.357939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>