141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0054 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  62.68 
 
 		 243 aa  249  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  40.76 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  38.05 
 
 		 205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  42.16 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  35.03 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  34.54 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  33.66 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  33.88 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  32.99 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  28.5 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  29.5 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  28.26 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  30.1 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  27.75 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  31.22 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  27.23 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  25 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  28.14 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  31.35 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  31.35 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  28.27 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  28.35 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  28.35 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  27.32 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  25.26 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  25.53 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  28.8 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  28.96 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  28.5 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  27.37 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  26.32 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1296  hypothetical protein  29.9 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  28.27 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  29.21 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  28.65 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  26.8 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  27.66 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  26.87 
 
 		 232 aa  62  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  29.38 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  25.74 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  26.56 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  28.27 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  26.56 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  27.7 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  27.75 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  26.5 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  29.47 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  25.64 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  30.37 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  27.51 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  28.14 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  27.14 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  25.87 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  27.32 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  27.32 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0170  hypothetical protein  28.93 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  28.97 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  28.7 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2681  hypothetical protein  29.95 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0401595  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  25.38 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  25.63 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  27.81 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0149  hypothetical protein  29.59 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  26.2 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  28.12 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  27.64 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  26.56 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  29.53 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  26.18 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  23.53 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  25.97 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  26.29 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  26.29 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  26.29 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  26.29 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  25.77 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  25.27 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  30.94 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  30.94 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6256  hypothetical protein  28 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802451  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1488  hypothetical protein  23.16 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00071  hypothetical protein  25.64 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  23.86 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  26.42 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  28.87 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  22.5 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2920  protein of unknown function DUF502  30.39 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  26.63 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0008  hypothetical protein  25.23 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  25.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  25.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  25.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01799  hypothetical protein  29.75 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  25.51 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  24.1 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7052  protein of unknown function DUF502  27.36 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  25.51 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  25.51 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>