173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0045 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0045  ring-cleaving dioxygenase  100 
 
 
126 aa  255  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.985794  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.85 
 
 
134 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.781159  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.94 
 
 
125 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1277  hitchhiker  0.00852425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4634  ring-cleaving dioxygenase  62.4 
 
 
126 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52890  ring-cleaving dioxygenase  62.9 
 
 
126 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.908262  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1528  hypothetical protein  58.06 
 
 
126 aa  159  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4359  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.38 
 
 
128 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  hitchhiker  0.00717168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3172  glyoxalase family protein  58.87 
 
 
132 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.139884  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.87 
 
 
132 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.468879 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1001  extradiol ring-cleaving dioxygenase, putative  56.1 
 
 
128 aa  150  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.45 
 
 
141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0943  putative extradiol ring-cleaving dioxygenase  56.1 
 
 
128 aa  149  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.16 
 
 
131 aa  148  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2621  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.16 
 
 
131 aa  148  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000365872  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.35 
 
 
131 aa  148  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.54 
 
 
131 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1574  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.54 
 
 
131 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2800  glyoxalase family protein  56.45 
 
 
132 aa  147  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2424  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.45 
 
 
132 aa  147  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.780094  hitchhiker  0.00163116 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0872  glyoxalase family protein  55.28 
 
 
132 aa  147  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.54 
 
 
131 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.823568  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2721  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.35 
 
 
131 aa  146  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.72 
 
 
131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2351  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.79 
 
 
128 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2401  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.79 
 
 
128 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1734  glyoxalase family protein  57.72 
 
 
131 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.47 
 
 
173 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444424  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1322  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55 
 
 
130 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0767303  normal  0.10787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.78 
 
 
125 aa  134  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3893  glyoxalase, putative  52.76 
 
 
129 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222146  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2211  30S ribosomal protein S15  48.44 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4115  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
127 aa  128  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.726445  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2595  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.1 
 
 
125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3266  putative metallothiol transferase  52.1 
 
 
126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.45 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1338  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.83 
 
 
131 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.184325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2987  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.26 
 
 
128 aa  124  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.382223  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1553  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.17 
 
 
127 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.111375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4854  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.94 
 
 
127 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0294126 
 
 
-
 
NC_003296  RS03174  hypothetical protein  52.94 
 
 
126 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1665  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.94 
 
 
127 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.94 
 
 
127 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1601  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.94 
 
 
127 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1693  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.94 
 
 
127 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1623  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.94 
 
 
127 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0844226  normal  0.672862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.33 
 
 
130 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930007  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4038  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.41 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1453  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.45 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0851141  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4030  hypothetical protein  45.16 
 
 
135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0866  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.8 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4553  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.91 
 
 
135 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1815  putative ring-cleaving dioxygenase  52.13 
 
 
106 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00491461  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2716  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.54 
 
 
147 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2855  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.67 
 
 
147 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2894  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.17 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.33 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7861  hypothetical protein  40.31 
 
 
136 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.433206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3017  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.17 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.2 
 
 
130 aa  91.3  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1729  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.86 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02088  hypothetical protein  52.05 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458223  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003199  hypothetical protein  43.16 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003185  hypothetical protein  43.16 
 
 
95 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003189  hypothetical protein  43.16 
 
 
95 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3833  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.5 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  37.5 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0964  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.54 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.06 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127452  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2605  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.59 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123177  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02089  hypothetical protein  66.67 
 
 
44 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3300  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.39 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1685  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.65 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2691  putative ring-cleaving dioxygenase  36.43 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29360  glyoxalase, Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  36.76 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4481  putative lactoylglutathione lyase  36.09 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298655  unclonable  0.00000133457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31640  putative ring-cleaving dioxygenase  36.43 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.195652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0848  hypothetical protein  33.06 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2568  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.88 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476855  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3956  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.59 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000520139  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.88 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0183  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.37 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3398  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.46 
 
 
136 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2966  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.12 
 
 
141 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0114  glyoxalase family protein  35.34 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.000000000210861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0321  glyoxalase family protein  35.34 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000322119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2837  glyoxalase family protein  35.34 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000107738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2248  glyoxalase family protein  35.34 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384082  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0115  glyoxalase family protein  35.34 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000344124  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0131  glyoxalase family protein  35.34 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000275668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2299  glyoxalase family protein  35.34 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000195056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2322  glyoxalase family protein  35.34 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000000100252  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0174  glyoxalase family protein  30.37 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.83 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0168  glyoxalase family protein  30.37 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.62 
 
 
182 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2248  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.887282  normal  0.86404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>