18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0031 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0031  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  227  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.648247  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1450  hypothetical protein  49.06 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.653118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16680  hypothetical protein  47.62 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0308  hypothetical protein  50.48 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1504  hypothetical protein  44.64 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4218  hypothetical protein  45.05 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1109  hypothetical protein  42.86 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4113  hypothetical protein  43.93 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2236  hypothetical protein  39.81 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.663674  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3361  hypothetical protein  45.54 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.731183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1068  hypothetical protein  46.3 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2235  hypothetical protein  52.38 
 
 		 122 aa  92.8  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.636157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2236  hypothetical protein  42.34 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39310  hypothetical protein  46.23 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2235  hypothetical protein  48.39 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3065  hypothetical protein  29.52 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000020575  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2275  hypothetical protein  29.36 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0500885  hitchhiker  0.00379046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3294  hypothetical protein  39.74 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.668778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>