71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0011 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0011  Smg protein  100 
 
 		 148 aa  299  9e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0190  hypothetical protein  31.33 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0078  hypothetical protein  32.48 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2470  hypothetical protein  36.31 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2840  hypothetical protein  34.44 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0192  hypothetical protein  36.08 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0046  hypothetical protein  33.54 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.249681  normal  0.251569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0429  protein of unknown function DUF494  35 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0295235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0429  hypothetical protein  35 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000035196  hitchhiker  0.000953721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03135  hypothetical protein  35 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0891254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3478  hypothetical protein  35 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000737993  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00388  hypothetical protein  34.18 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03086  hypothetical protein  35 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2631  hypothetical protein  35.1 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002060  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0637077 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3767  hypothetical protein  33.12 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000724852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3580  hypothetical protein  33.12 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0216587  normal  0.15109 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4607  hypothetical protein  33.12 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0145872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3669  hypothetical protein  33.12 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00596599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3716  hypothetical protein  33.12 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195786  hitchhiker  0.0087907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0098  protein of unknown function DUF494  36.92 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0619  hypothetical protein  31.21 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000133668  normal  0.0223362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0318  hypothetical protein  31.21 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0553382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3880  hypothetical protein  31.21 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000155024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3673  hypothetical protein  32.5 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3708  hypothetical protein  32.5 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0588951  normal  0.0775927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3601  hypothetical protein  32.5 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.967939  normal  0.75952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0041  hypothetical protein  31.41 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.479355 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3600  hypothetical protein  32.5 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3771  hypothetical protein  32.5 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0358  hypothetical protein  31.25 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0362316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0027  hypothetical protein  32.05 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0280  hypothetical protein  32.45 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0038  hypothetical protein  31.85 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272353  hitchhiker  0.00000478432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0032  hypothetical protein  31.85 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.263953  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0030  hypothetical protein  31.85 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3011  hypothetical protein  31.78 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0027  hypothetical protein  31.41 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0023  smg protein  30.57 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0035  smg protein  31.21 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0441  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0038  hypothetical protein  29.49 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0240972  normal  0.0588054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0075  hypothetical protein  31.21 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1932  hypothetical protein  31.21 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3733  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0219061  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1868  hypothetical protein  31.21 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3588  hypothetical protein  34.42 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4509  hypothetical protein  29.94 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000588298  hitchhiker  0.000163466 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3787  hypothetical protein  30 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00193102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0034  protein of unknown function DUF494  29.49 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0034  hypothetical protein  29.49 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0030  hypothetical protein  29.49 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0027  hypothetical protein  29.49 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0035  hypothetical protein  29.49 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0034  hypothetical protein  30.19 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00025  smg protein  29.75 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04052  hypothetical protein  32.47 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2325  hypothetical protein  31.03 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.801617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0026  hypothetical protein  29.75 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2276  protein of unknown function DUF494  33.85 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3966  hypothetical protein  29.38 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3882  hypothetical protein  29.82 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4642  hypothetical protein  27.49 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2099  smg protein  28.21 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000321038  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0087  hypothetical protein  27.56 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000255352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5116  protein of unknown function DUF494  27.06 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2089  protein of unknown function DUF494  28.06 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.596862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3863  hypothetical protein  24.67 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0017  protein of unknown function DUF494  30.1 
 
 		 146 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  0.0565587 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0016  smg family protein  30.1 
 
 		 146 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>