More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0062 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0008  23S ribosomal RNA segment  83.97 
 
 		 3298 bp  698    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0041  23S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 3027 bp  797    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0513089  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0032  23S ribosomal RNA  99.83 
 
 		 2972 bp  5852    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.922889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  84.65 
 
 		 2944 bp  676    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0054  23S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 2969 bp  747    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0031  23S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 3357 bp  646    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0025  23S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 3027 bp  797    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0059  23S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 2972 bp  5876    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0139247  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0008  23S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 3357 bp  646    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 3129 bp  700    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 3129 bp  700    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0030  23S ribosomal RNA segment  83.97 
 
 		 3298 bp  698    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00296414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0006  23S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 2969 bp  747    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 2946 bp  674    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 2946 bp  674    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0062  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2972 bp  5892    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  84.65 
 
 		 2943 bp  676    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  84.65 
 
 		 2944 bp  676    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0054  23S ribosomal RNA segment  83.97 
 
 		 3298 bp  698    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.26274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0049  23S ribosomal RNA segment  83.97 
 
 		 3298 bp  698    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 3129 bp  700    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 3129 bp  700    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  84.57 
 
 		 2946 bp  676    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0035  23S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 2969 bp  747    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0011  23S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 3529 bp  741    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0016  23S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 3088 bp  741    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0021  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 3260 bp  733    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0039  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  615  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000978357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0068  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  615  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00625643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0059  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  615  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0056  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  615  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000789359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0068  23S ribosomal RNA  82.86 
 
 		 2935 bp  579  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.502369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0079  23S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 2913 bp  533  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0020  23S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 3062 bp  533  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000158535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0009  23S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 2912 bp  533  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.363949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0064  23S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 2912 bp  533  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00853635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0071  23S ribosomal RNA  87.07 
 
 		 2912 bp  525  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.19372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0087  23S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 3085 bp  521  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0310291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0020  23S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 3044 bp  521  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00975854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0009  23S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 2913 bp  521  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00195667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0082  23S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 3044 bp  521  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00960446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0026  23S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 3044 bp  521  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000193882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0038  23S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 2913 bp  521  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000518778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0058  23S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 2913 bp  521  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00925109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0014  23S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 2913 bp  521  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0264747  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0023  23S ribosomal RNA  82.43 
 
 		 3000 bp  494  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0003  23S ribosomal RNA  87.36 
 
 		 3009 bp  496  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.168115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0029  23S ribosomal RNA  87.36 
 
 		 3009 bp  496  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.795841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0004  23S ribosomal RNA  86.53 
 
 		 3007 bp  488  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0015  23S ribosomal RNA  86.53 
 
 		 3007 bp  488  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.490165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0020  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 3039 bp  482  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.944496  normal  0.114862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0012  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 3039 bp  482  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0471385  normal  0.17133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0056  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 3039 bp  482  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.826455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0016  23S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 2811 bp  482  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629398  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0048  23S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 2811 bp  482  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0050  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2818 bp  478  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.502675  normal  0.618699 
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SA  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2903 bp  480  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SB  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2903 bp  480  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27693  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SC  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2903 bp  480  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SD  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2903 bp  480  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.635021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SE  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2903 bp  480  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.651063  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SF  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2903 bp  480  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SG  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2903 bp  480  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0008  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2669 bp  478  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0060  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2669 bp  478  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531271  normal  0.371135 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_R0066  23S ribosomal RNA  86.5 
 
 		 2885 bp  480  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0043  23S ribosomal RNA  86.5 
 
 		 2890 bp  480  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363579  decreased coverage  0.0035918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0040  23S ribosomal RNA  86.3 
 
 		 2871 bp  476  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0084  23S ribosomal RNA  81.87 
 
 		 2900 bp  476  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0759493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0030  23S ribosomal RNA  86.3 
 
 		 2871 bp  476  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0090  23S ribosomal RNA  81.87 
 
 		 2900 bp  476  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.133955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0004  23S ribosomal RNA  81.87 
 
 		 2900 bp  476  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0067  23S ribosomal RNA  81.87 
 
 		 2900 bp  476  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0064  23S ribosomal RNA  81.87 
 
 		 2900 bp  476  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0017  23S ribosomal RNA  81.87 
 
 		 2900 bp  476  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0029  23S ribosomal RNA  81.87 
 
 		 2900 bp  476  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  86.33 
 
 		 2972 bp  472  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0008  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2890 bp  472  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  decreased coverage  0.00656926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0063  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2890 bp  472  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1782  23S ribosomal RNA  87.88 
 
 		 2901 bp  472  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0411  23S ribosomal RNA  87.88 
 
 		 2902 bp  472  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0183  23S ribosomal RNA  87.88 
 
 		 2902 bp  472  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0021  23S ribosomal RNA  87.88 
 
 		 2902 bp  472  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0081  23S ribosomal RNA  87.88 
 
 		 2902 bp  472  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0170  23S ribosomal RNA  87.88 
 
 		 2902 bp  472  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0087  23S ribosomal RNA  81.76 
 
 		 2900 bp  468  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2909 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-7  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2912 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>