71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0046 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0046  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.150337  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0017  tRNA-Ala  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0013  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000441273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0048  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0033  tRNA-Ala  95.56 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0024  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.831109  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0033  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0034  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31263  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0373  10Sa RNA (tmRNA)  100 
 
 		 367 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0026  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0028  tRNA-Val  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0029  tRNA-Val  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.575368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0027  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07570  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.10137  normal  0.977811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0052  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0040  tRNA-Ala  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0421069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0041  tRNA-Ala  85.33 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.910553  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4254  10Sa RNA (tmRNA)  96.55 
 
 		 364 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000812239  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0057  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0335757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4223    96.55 
 
 		 364 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140145  normal  0.0140433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0033  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000837062 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177438  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0029  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0012    96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10750  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0025    96.43 
 
 		 362 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15510  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0037  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13840  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13890  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0287375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0035  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522217  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0041  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.532077  normal  0.0646966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0033  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.526612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0024    96.43 
 
 		 362 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16730  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251043  normal  0.0595565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16760  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268589  normal  0.0588163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0081  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.659865  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0036  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0038  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_265  tRNA-Ala  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0028  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0031  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000451767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0081    96.43 
 
 		 380 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.124848  normal  0.269068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0032  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.463355  normal  0.0505941 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0005  tRNA-Ala  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0055  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.623624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0051  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0067  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0193127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0068  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0550455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0053  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4764    96.15 
 
 		 363 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000108878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5057  10Sa RNA (tmRNA)  96.15 
 
 		 363 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.434725  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1394  tRNA-Ala  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0021  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.178891  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0069    96.15 
 
 		 360 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.217492 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0093  tRNA-Val  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0019    96.15 
 
 		 384 bp  44.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  unclonable  0.0000024281 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4975    96.15 
 
 		 363 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0450462  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2909    96.15 
 
 		 363 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0323379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2910    96.15 
 
 		 363 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2891    96.15 
 
 		 363 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0001  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000732072  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2840    96.15 
 
 		 363 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0009  tRNA-Thr  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3023    96.15 
 
 		 363 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0263643 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3178s    96.15 
 
 		 364 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3862    96.15 
 
 		 363 bp  44.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.896825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0013  tRNA-Ala  83.12 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0041    96.15 
 
 		 384 bp  44.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00705432  hitchhiker  0.00312299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>