35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0038 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  188  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000026023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0002  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 94 bp  69.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00386906  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer02  tRNA-Ser  85.26 
 
 		 97 bp  69.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0009  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496471  hitchhiker  0.00256028 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0043  tRNA-Ser  95 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.569209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0007  tRNA-Ser  95 
 
 		 94 bp  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.12584  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0002  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 95 bp  61.9  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0006  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0046  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 94 bp  58  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.506638  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0008  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 96 bp  56  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000013912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0042  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0068  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 96 bp  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0014  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 96 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000019033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0061  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0952351  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0060  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100748  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0028  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000693874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0024  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0025  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217878  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0100  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 96 bp  46.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.170842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6042  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0656  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0015  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0048  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000235294  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0045  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0032  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0004  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327404  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0022  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0034  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.248772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0058  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325073  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0041  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0253572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0020  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0017  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576804  normal  0.691356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0057  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.328322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0015  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>