249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0007 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000625255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0004  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0007  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 95 bp  81.8  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.025626  hitchhiker  0.00000743472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0034  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 92 bp  81.8  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0004  tRNA-Ser  92 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.020254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0053  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 94 bp  67.9  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00121332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0004  tRNA-Ser  84.21 
 
 		 95 bp  61.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366814 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.6315500000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0060  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000115188  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0033  tRNA-Ser  86.17 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000107313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0037  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675311 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0024  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6042  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0025  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217878  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.569209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0025  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112044  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0068  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  58  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0006  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 96 bp  58  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0002  tRNA-Ser  84.21 
 
 		 93 bp  56  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000899468  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t07  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506644  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4560  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0913747  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0038  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0633  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248026  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0010  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0051  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0011  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0060178  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0010  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.710813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0033  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.172474  normal  0.681526 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0033  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000207879  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0448  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.359663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0010  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0051  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000406758  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0038  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00055942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0006  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0016  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  96.67 
 
 		 126 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0035  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0068  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0018  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0023  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000401861 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0006  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0671  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.417129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0056  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000388656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0006  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0776  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0954361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0025  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0021  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00559548  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0006  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000116718  hitchhiker  6.42112e-17 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0057  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0111  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  hitchhiker  0.0000655456 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0025  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4314  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.650713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0106  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t17  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0038  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.231561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0009  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0017  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576804  normal  0.691356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0018  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0208522  hitchhiker  0.00000010286 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0025  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000078606  normal  0.16194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0032  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0116  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0194907  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0015  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0066  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00163913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0023  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0032  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000491895  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0033  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.985807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0029  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.287395  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0062  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 95 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0002  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 95 bp  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000013912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0011  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0038  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0034  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0033  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0052  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>