More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1651 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 242 aa  487  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  34.45 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  37.38 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  39.38 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 223 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  35.75 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  37.63 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 230 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  33.16 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 231 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  34.6 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  30.93 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2320  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 236 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 219 aa  95.5  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 268 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  28.08 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 225 aa  89  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 237 aa  85.5  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  35.04 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>