90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1539 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
187 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.31 
 
 
186 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  36.63 
 
 
184 aa  120  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  38.82 
 
 
185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  38.38 
 
 
184 aa  115  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  37.36 
 
 
188 aa  114  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  35.39 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  38.89 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.88 
 
 
180 aa  111  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  34.09 
 
 
181 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  36.07 
 
 
183 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  36.07 
 
 
183 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  36.07 
 
 
183 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  35.68 
 
 
183 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  38.73 
 
 
183 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  36.42 
 
 
183 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  32.39 
 
 
185 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  35.47 
 
 
181 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  39.78 
 
 
186 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  33.16 
 
 
188 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  35.47 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  35.47 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.47 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  35.47 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  35.47 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  35.47 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  35.47 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  35.47 
 
 
184 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  35.47 
 
 
184 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  36.52 
 
 
187 aa  99  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  36.52 
 
 
187 aa  98.6  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  33.72 
 
 
183 aa  97.8  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  33.92 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  33.33 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  31.64 
 
 
189 aa  95.1  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  31.98 
 
 
181 aa  94.7  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  34.09 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  34.09 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.61 
 
 
182 aa  94.4  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  34.09 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  34.09 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  34.09 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  38.25 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  32.76 
 
 
193 aa  91.7  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  30.41 
 
 
183 aa  91.3  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  39.41 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  32.02 
 
 
187 aa  89  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  35.03 
 
 
178 aa  85.1  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  33.33 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.29 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  25.15 
 
 
166 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  25.84 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.81 
 
 
159 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  23.24 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  29.31 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  24.47 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  24.47 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  23.94 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  23.94 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  23.94 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  23.94 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.41 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  27.44 
 
 
152 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.42 
 
 
163 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  24.74 
 
 
167 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  23.94 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.71 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  23.94 
 
 
167 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25 
 
 
156 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.04 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  29.24 
 
 
154 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  32.61 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  27.95 
 
 
152 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.03 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  23.5 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.99 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.47 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  25.58 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  25.85 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.81 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  25.36 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  29.25 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  26.83 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.3 
 
 
162 aa  42  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 
165 aa  41.6  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.16 
 
 
162 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  23.24 
 
 
162 aa  41.2  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  24.86 
 
 
167 aa  41.2  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  24.86 
 
 
167 aa  41.2  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.97 
 
 
172 aa  40.8  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>