More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1522 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  35.2 
 
 
140 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  35.2 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  35.2 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  35.2 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  35.2 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  35.2 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  35.2 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.4 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  32.43 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.33 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  27.42 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  30.58 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.01 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  31.71 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.07 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  31.78 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2106  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  26.4 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.93 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.15 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00516772  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.2 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.2 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.2 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.2 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  32.23 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  32.61 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.2 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.8 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.2 
 
 
134 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.2 
 
 
134 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.2 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  29.75 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 
133 aa  60.1  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  30 
 
 
132 aa  60.1  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  30.43 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.45 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  29.75 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  28.47 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.5 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2301  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.62 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  29.51 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
133 aa  58.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  32.82 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 
140 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.98 
 
 
177 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.19 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  26.61 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.4 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  42.62 
 
 
177 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.07 
 
 
174 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  31.01 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  33.09 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.23 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  42.62 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  27.42 
 
 
141 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.05 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.21 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  39.34 
 
 
177 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  27.5 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0197  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.12 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.058797  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.11 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.45 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.11 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  36.36 
 
 
174 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  26.89 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3106  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.36 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0993721  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  42.62 
 
 
177 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  23.14 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  23.14 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  25 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0054  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.63 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.4 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.36 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>