94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1513 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 60 aa  118  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  55.36 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  44.83 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  45.1 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  46.43 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  45.1 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  42.31 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  47.06 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.74 
 
 		 63 aa  47.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0920  preprotein translocase subunit SecE  38.33 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  40.43 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4389  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515047  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  42.11 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4553  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00306238  hitchhiker  0.000000000000770632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4357  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000161707  normal  0.74438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4476  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000966143  hitchhiker  0.00190417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4479  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000837942  decreased coverage  0.00000000000000405738 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4214  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.05954e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0204  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00011223  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4520  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  41.38 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03857  translocase  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000542011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0333  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000137856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4044  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000141034  hitchhiker  0.00697666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4429  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000053467  hitchhiker  0.0000280733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4469  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000281914  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  37.93 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0199  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03810  hypothetical protein  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5446  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000383194  hitchhiker  0.0067856 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4014  preprotein translocase, SecE subunit  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000048748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0191  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000178123  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3866  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.21747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  45.83 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3737  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3891  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00311904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3341  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  53.33 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  35 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1055  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.307784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  32.76 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  40.43 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0613  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000809702 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  43.75 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00231  preprotein translocase subunit SecE  40.43 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2427  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  44 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  42.59 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  38.78 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  38.78 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  44 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  42.55 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3452  preprotein translocase, SecE subunit  48.84 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.0121626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  53.49 
 
 		 168 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  31.67 
 
 		 61 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0688  putative SecE preprotein translocase subunit  37.29 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.8362399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0347  preprotein translocase subunit SecE  35.29 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000107715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  35.19 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  31.67 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1493  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.394674  normal  0.332847 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4703  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000037355  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  30 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1952  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000115861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  29.82 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0171  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158213  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  30 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  47.83 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4778  preprotein translocase, SecE subunit  45.45 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0308263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00689  Preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000478021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2955  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058438  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0145  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000598149  normal  0.0330046 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  36.17 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4330  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000313064  hitchhiker  0.00000000188244 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0667  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 60 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.986958  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1669  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 59 aa  40  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00942415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>