More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1452 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1452  response regulator receiver and unknown domain protein  100 
 
 
224 aa  431  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  34.67 
 
 
227 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  33.63 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  33.94 
 
 
226 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  31.56 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  31 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  35.29 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  35.29 
 
 
222 aa  118  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.14 
 
 
240 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  33.33 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.11 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  33.49 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.11 
 
 
239 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.11 
 
 
239 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.11 
 
 
239 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.11 
 
 
239 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.21 
 
 
237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  30.7 
 
 
240 aa  115  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  33.33 
 
 
224 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  32.75 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.14 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.58 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  32 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  30.63 
 
 
225 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.34 
 
 
228 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  32.74 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  33.33 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.94 
 
 
221 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.84 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  31.56 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0699  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.63 
 
 
246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  29.39 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.88 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  32.29 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  29.57 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  29.57 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  30.94 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.57 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.57 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.57 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.57 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.14 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.57 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  31.19 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  29.57 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.39 
 
 
220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.39 
 
 
220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.39 
 
 
220 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  31.56 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  33.63 
 
 
228 aa  108  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  30.28 
 
 
225 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  31.28 
 
 
241 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.84 
 
 
228 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0349  response regulator receiver  30 
 
 
225 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  31.56 
 
 
235 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  31.56 
 
 
235 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.28 
 
 
231 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  30 
 
 
243 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  31.56 
 
 
235 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2791  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.14 
 
 
228 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00727267  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  33.04 
 
 
224 aa  105  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  29.36 
 
 
225 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  29.82 
 
 
225 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  29.82 
 
 
225 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00590  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with citA  29.2 
 
 
226 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3005  response regulator receiver and unknown domain protein  29.2 
 
 
226 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0671  two-component response regulator DpiA  29.2 
 
 
226 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00334128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  31.14 
 
 
235 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  29.78 
 
 
235 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3024  two-component response regulator DpiA  29.2 
 
 
226 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.284092  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00579  hypothetical protein  29.2 
 
 
226 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0708  two-component response regulator DpiA  29.2 
 
 
226 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.767771  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0639  two-component response regulator DpiA  29.2 
 
 
226 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0643  two-component response regulator DpiA  29.2 
 
 
226 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  29.78 
 
 
235 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  29.68 
 
 
230 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0535  two-component response regulator DpiA  29.2 
 
 
226 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  29.82 
 
 
225 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  29.36 
 
 
225 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  29.96 
 
 
230 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.98 
 
 
217 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  31.22 
 
 
231 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  31.84 
 
 
227 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  30 
 
 
225 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  30 
 
 
225 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  32.29 
 
 
230 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  30.57 
 
 
237 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318963 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  30 
 
 
225 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  30.4 
 
 
230 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  29.96 
 
 
230 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  30.26 
 
 
230 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1922  response regulator  29.6 
 
 
229 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  29.96 
 
 
230 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  31.98 
 
 
226 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2305  response regulator receiver and unknown domain protein  35.24 
 
 
230 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  29.96 
 
 
230 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3172  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  28.57 
 
 
228 aa  98.2  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00871756  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  31.82 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.22 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2968  response regulator receiver and unknown domain protein  28.7 
 
 
228 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>