More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1418 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  100 
 
 
447 aa  894    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  55.3 
 
 
449 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  55.14 
 
 
446 aa  474  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  56.98 
 
 
445 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  53.95 
 
 
453 aa  475  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.92 
 
 
447 aa  472  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  54.88 
 
 
448 aa  474  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  53.15 
 
 
443 aa  471  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.2 
 
 
446 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  53.85 
 
 
449 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  53.5 
 
 
446 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  53.38 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  53.38 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  53.38 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  53.38 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  54.14 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  53.38 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  53.38 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  53.15 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  53.38 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.48 
 
 
481 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  53.15 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  53.15 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  52.87 
 
 
479 aa  455  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  52.53 
 
 
450 aa  455  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  53.26 
 
 
446 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  57.21 
 
 
452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  52.37 
 
 
448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  52.51 
 
 
444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.3 
 
 
452 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  56.06 
 
 
454 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  56.06 
 
 
454 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  50.82 
 
 
455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  50.82 
 
 
455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  50.82 
 
 
455 aa  442  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  53.26 
 
 
450 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  52.82 
 
 
512 aa  441  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.54 
 
 
447 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  52.97 
 
 
453 aa  441  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  53.2 
 
 
452 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  52.55 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  51.7 
 
 
463 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  51.92 
 
 
518 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  52.08 
 
 
444 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  51.24 
 
 
433 aa  432  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  49.89 
 
 
441 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  52.4 
 
 
449 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  53.18 
 
 
453 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  51.67 
 
 
445 aa  428  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.56 
 
 
454 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.32 
 
 
443 aa  428  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  51.47 
 
 
433 aa  431  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  47.07 
 
 
476 aa  429  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.61 
 
 
491 aa  429  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  49.32 
 
 
451 aa  427  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  52.95 
 
 
453 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  50.35 
 
 
492 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  48.93 
 
 
442 aa  428  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  51.04 
 
 
508 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  49.23 
 
 
454 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  52.36 
 
 
514 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  50.34 
 
 
451 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  49.32 
 
 
449 aa  423  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  46.51 
 
 
521 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  48.49 
 
 
443 aa  418  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  47.95 
 
 
443 aa  419  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3351  signal recognition particle protein  50.12 
 
 
551 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.31296 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1006  signal recognition particle protein  50.11 
 
 
434 aa  418  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0974  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.53 
 
 
462 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.86 
 
 
449 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1190  signal recognition particle protein  51.42 
 
 
514 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260849  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  48.46 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  49.77 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.87 
 
 
507 aa  418  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  48.15 
 
 
520 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2243  signal recognition particle protein  50.24 
 
 
519 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739942  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  47.71 
 
 
515 aa  412  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  47.24 
 
 
525 aa  412  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  48.19 
 
 
449 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  49.2 
 
 
436 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.53 
 
 
512 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  49.31 
 
 
521 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  49.89 
 
 
515 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  47.95 
 
 
449 aa  412  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  50.24 
 
 
452 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  50.24 
 
 
452 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  50.59 
 
 
459 aa  414  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.41 
 
 
515 aa  415  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  47.26 
 
 
441 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  49.06 
 
 
493 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  48.84 
 
 
515 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  49.09 
 
 
449 aa  408  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  48.84 
 
 
524 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  47.21 
 
 
444 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  49.09 
 
 
449 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.19 
 
 
551 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  47.29 
 
 
449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  49.77 
 
 
453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  50 
 
 
458 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  47.73 
 
 
517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>