More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1353 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1353  Ribonuclease H  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  56.04 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  55.49 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  53.01 
 
 		 218 aa  171  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  55.49 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  47.54 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  53.3 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.35 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  48.66 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 207 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 218 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  160  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  48.68 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  48.68 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 254 aa  159  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 268 aa  158  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  48.11 
 
 		 213 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  45.05 
 
 		 256 aa  157  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  42.54 
 
 		 242 aa  157  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  50.28 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  46.96 
 
 		 221 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  53.04 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  50.28 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  50 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 226 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 205 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 240 aa  154  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  46.15 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  49.73 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 250 aa  152  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  47.51 
 
 		 219 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  50 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  47.57 
 
 		 308 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  50.54 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  48.15 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  46.96 
 
 		 203 aa  150  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  48.35 
 
 		 198 aa  150  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  48.35 
 
 		 198 aa  150  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 197 aa  150  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 338 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  48.15 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  48.35 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  45.05 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  47.51 
 
 		 307 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.96 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  48.62 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  45.05 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 299 aa  148  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  47.8 
 
 		 204 aa  148  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  44.56 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 224 aa  147  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  48.35 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 209 aa  146  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  46.11 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  50 
 
 		 292 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1966  ribonuclease HII  51.91 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.413568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  45.65 
 
 		 260 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>