More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1344 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  100 
 
 		 292 aa  589  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  41.69 
 
 		 373 aa  205  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  41.89 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  43.34 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  39.06 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  38.57 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.05 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  38.23 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  39.3 
 
 		 298 aa  188  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  38.93 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  38.93 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  39.6 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  35.64 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  39.26 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  39.46 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  39.46 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  39.38 
 
 		 303 aa  186  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.05 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  35.03 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  37 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  39.44 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  40.07 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  37.25 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  41.03 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.05 
 
 		 296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.05 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.05 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.05 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  42.03 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.05 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.05 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.05 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.05 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  35.25 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.05 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  39.12 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  40.83 
 
 		 293 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.71 
 
 		 296 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  41.01 
 
 		 302 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.67 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  39.02 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.67 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  38.7 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  39.16 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.67 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  39.8 
 
 		 317 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  38.36 
 
 		 346 aa  178  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  38.21 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  36.49 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  36.61 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  37.67 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  36.03 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.41 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  34.8 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  38.01 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  39.25 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  39.66 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  37.5 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  35.76 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  39.19 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  38.28 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  38.26 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  39.02 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  38.91 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  37.7 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  39.39 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  38.91 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  36.36 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.57 
 
 		 299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.58 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.33 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  39.25 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.57 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  37.54 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.57 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.57 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.57 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  35.84 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  39.59 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  39.43 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 		 300 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  39.59 
 
 		 309 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  38.36 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  35.25 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  35.62 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  36.75 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.54 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.25 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.8 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  34.11 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  38.57 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.23 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  40.14 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.23 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  36.52 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  39.93 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  38.91 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  38.85 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.79 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>