245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1260 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
475 aa  921    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  65.61 
 
 
443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  49.22 
 
 
453 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  47.86 
 
 
452 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  50.11 
 
 
454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  50.33 
 
 
476 aa  395  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  47.3 
 
 
446 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  47.19 
 
 
446 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  47.1 
 
 
446 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  47.19 
 
 
446 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  47.19 
 
 
446 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  46.97 
 
 
446 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  46.74 
 
 
446 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  46.97 
 
 
446 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  46.97 
 
 
446 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  50.81 
 
 
456 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  46.97 
 
 
446 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  46.97 
 
 
446 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  48.8 
 
 
455 aa  362  9e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  47.3 
 
 
449 aa  360  4e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  44.52 
 
 
470 aa  359  8e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  44.2 
 
 
468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  44.64 
 
 
453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  44.15 
 
 
453 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  46.97 
 
 
445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  46.97 
 
 
445 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  46.97 
 
 
445 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  46.97 
 
 
445 aa  342  7e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  42.32 
 
 
455 aa  342  8e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  46.74 
 
 
445 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  46.86 
 
 
445 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  46.74 
 
 
445 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  46.52 
 
 
445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  46.36 
 
 
459 aa  340  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  42.22 
 
 
455 aa  339  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  46.03 
 
 
445 aa  338  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  46.98 
 
 
447 aa  338  9e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  46.65 
 
 
447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  42.98 
 
 
452 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  44.84 
 
 
454 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  46.14 
 
 
452 aa  329  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  46.14 
 
 
452 aa  329  8e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  46.14 
 
 
451 aa  329  8e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  46.14 
 
 
452 aa  329  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  43.86 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  42.2 
 
 
486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  45.68 
 
 
451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  45.88 
 
 
452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  45.92 
 
 
452 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  46.74 
 
 
451 aa  326  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  40.04 
 
 
486 aa  323  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  42.73 
 
 
446 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  46.62 
 
 
448 aa  322  7e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  42.44 
 
 
452 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  41.91 
 
 
464 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  45.68 
 
 
452 aa  317  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  41.72 
 
 
464 aa  315  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  41.14 
 
 
453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  40.53 
 
 
451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  40.81 
 
 
456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  45.68 
 
 
452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  45.92 
 
 
452 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  39.43 
 
 
454 aa  310  5e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  41.08 
 
 
452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  38.37 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  38.37 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  43.45 
 
 
452 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  40.8 
 
 
457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  38.36 
 
 
458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  42.28 
 
 
461 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  43.27 
 
 
460 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  39.16 
 
 
450 aa  301  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  38.94 
 
 
450 aa  300  3e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  38.5 
 
 
454 aa  300  4e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  41.2 
 
 
466 aa  300  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  39.47 
 
 
457 aa  298  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  40.57 
 
 
461 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  40.23 
 
 
462 aa  298  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  42.79 
 
 
453 aa  297  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  39.41 
 
 
457 aa  297  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  38.23 
 
 
469 aa  296  5e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  39.09 
 
 
461 aa  296  6e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  40.04 
 
 
465 aa  296  8e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  41.34 
 
 
455 aa  293  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  42.86 
 
 
451 aa  291  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  41.22 
 
 
450 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  40.99 
 
 
449 aa  290  4e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  39.05 
 
 
483 aa  289  7e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  37.17 
 
 
484 aa  287  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  36.28 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  38.03 
 
 
461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  38.02 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  37.64 
 
 
447 aa  283  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  37.64 
 
 
447 aa  283  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  42.15 
 
 
457 aa  280  4e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  39.17 
 
 
448 aa  277  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  42.05 
 
 
467 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  41.2 
 
 
468 aa  277  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  38.65 
 
 
470 aa  276  5e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  37.14 
 
 
447 aa  276  6e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>