More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1242 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 164 aa  327  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 161 aa  143  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  46.15 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 159 aa  133  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  42.95 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_676  transcription elongation factor  44.52 
 
 		 265 aa  130  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00449564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  46 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  48.67 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  49.23 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  43.51 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0770  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.134897  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 158 aa  124  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 160 aa  123  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  46.94 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  41.78 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  41.14 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  41.14 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  44.68 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  44.68 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0696  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 266 aa  120  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.31866  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 203 aa  120  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  42.14 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  43.54 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  43.84 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  44.44 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  41.55 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  42.86 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>