More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1224 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  100 
 
 
564 aa  1126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  36.62 
 
 
599 aa  312  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.61 
 
 
600 aa  305  1e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  37.47 
 
 
601 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  39.67 
 
 
600 aa  294  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.88 
 
 
595 aa  294  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  38.94 
 
 
626 aa  292  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  40.16 
 
 
598 aa  289  9e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  40.16 
 
 
598 aa  289  9e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  39.62 
 
 
598 aa  289  9e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  40.16 
 
 
571 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  2.15576e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  40.16 
 
 
598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.94887e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  43.13 
 
 
611 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  40.16 
 
 
598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  40.16 
 
 
598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  40.16 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.25124e-06  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  40.16 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  40.16 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.62 
 
 
599 aa  288  3e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  37.26 
 
 
588 aa  288  3e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  42.36 
 
 
599 aa  287  3e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.88 
 
 
614 aa  283  4e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.25747e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  38.25 
 
 
598 aa  283  4e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  45.93 
 
 
605 aa  283  8e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  35.97 
 
 
590 aa  282  9e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  35.76 
 
 
590 aa  281  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.96 
 
 
604 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  44.07 
 
 
601 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  37.05 
 
 
604 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  42.62 
 
 
652 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  40.24 
 
 
544 aa  280  6e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.06361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  37.53 
 
 
595 aa  279  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  37.28 
 
 
595 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  38.85 
 
 
604 aa  276  9e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  35 
 
 
577 aa  275  1e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  39.77 
 
 
598 aa  275  2e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  36.93 
 
 
578 aa  274  3e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  39.83 
 
 
593 aa  274  4e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  33.69 
 
 
588 aa  273  5e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  39.27 
 
 
554 aa  273  5e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  43.42 
 
 
641 aa  273  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  43.42 
 
 
641 aa  273  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  38.58 
 
 
572 aa  273  7e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  44.26 
 
 
629 aa  273  8e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  39.02 
 
 
655 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  39.61 
 
 
651 aa  272  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  40.47 
 
 
605 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  40.47 
 
 
605 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  37.37 
 
 
592 aa  270  7e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  43.49 
 
 
642 aa  268  3e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  40.27 
 
 
576 aa  268  3e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  9.4448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  38.95 
 
 
583 aa  266  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  40.38 
 
 
575 aa  266  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  37.86 
 
 
591 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  35.81 
 
 
601 aa  266  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  39.53 
 
 
573 aa  265  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  40.27 
 
 
573 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  37.59 
 
 
587 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  37.45 
 
 
592 aa  263  5e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  41.26 
 
 
639 aa  263  7e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  40.27 
 
 
574 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  40.27 
 
 
574 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  40.27 
 
 
574 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  44.82 
 
 
627 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  38.12 
 
 
582 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  44.54 
 
 
629 aa  262  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  40.27 
 
 
574 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  38.31 
 
 
587 aa  262  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  39.46 
 
 
623 aa  261  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  39.46 
 
 
679 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  39.94 
 
 
601 aa  259  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  39 
 
 
584 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  38.69 
 
 
656 aa  259  8e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  41.3 
 
 
682 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  40.35 
 
 
633 aa  258  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  39.13 
 
 
580 aa  258  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  40.27 
 
 
575 aa  257  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  41.36 
 
 
665 aa  257  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  37.7 
 
 
586 aa  257  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  35.17 
 
 
588 aa  257  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  39.45 
 
 
633 aa  256  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  42.64 
 
 
587 aa  256  7e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  40.27 
 
 
576 aa  256  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  39.73 
 
 
574 aa  256  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.82839e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  41.1 
 
 
684 aa  256  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  37.7 
 
 
588 aa  255  1e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  39.45 
 
 
574 aa  256  1e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.53498e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  38.08 
 
 
585 aa  256  1e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  39.89 
 
 
636 aa  255  2e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  39.45 
 
 
574 aa  254  2e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  39.78 
 
 
694 aa  254  2e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  40.18 
 
 
617 aa  254  2e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  40.44 
 
 
574 aa  254  2e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  39.45 
 
 
574 aa  254  2e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  41.3 
 
 
686 aa  255  2e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  39.45 
 
 
574 aa  254  2e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  34.54 
 
 
645 aa  255  2e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  37.71 
 
 
595 aa  254  3e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  38.24 
 
 
632 aa  254  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  39.41 
 
 
645 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>