More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1203 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 
374 aa  737    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  39.12 
 
 
365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 
380 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  36.91 
 
 
379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  40.48 
 
 
373 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  35.34 
 
 
369 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  41.11 
 
 
382 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  39.74 
 
 
377 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  45.86 
 
 
376 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  34.89 
 
 
374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  42.12 
 
 
374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  39.5 
 
 
372 aa  223  6e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  39.66 
 
 
369 aa  222  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  38.36 
 
 
371 aa  222  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  36.05 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  39.78 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  38.38 
 
 
364 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  38.38 
 
 
403 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  40.51 
 
 
357 aa  219  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  38.24 
 
 
382 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1106  cell cycle protein  36.19 
 
 
371 aa  217  2e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.860681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  39.84 
 
 
413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  39.01 
 
 
370 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  42.19 
 
 
379 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  42.19 
 
 
379 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  39.17 
 
 
387 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  38.24 
 
 
362 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  38.11 
 
 
366 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  37.39 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  42.51 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  39.83 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  37.74 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  39.83 
 
 
366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  42.2 
 
 
371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  43.9 
 
 
368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  42.51 
 
 
367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  42.51 
 
 
367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  43.29 
 
 
384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  43.53 
 
 
361 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  42.16 
 
 
368 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  42.16 
 
 
368 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  42.16 
 
 
368 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  42.16 
 
 
368 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  42.16 
 
 
367 aa  212  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  43.21 
 
 
368 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  37.15 
 
 
372 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  36.81 
 
 
378 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  39.18 
 
 
377 aa  210  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  33.58 
 
 
417 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  43.9 
 
 
383 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  33.58 
 
 
417 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  43.77 
 
 
373 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  42.28 
 
 
366 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  37.34 
 
 
404 aa  209  5e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  39.82 
 
 
412 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  42.86 
 
 
373 aa  209  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  42.86 
 
 
368 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 
366 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  37.57 
 
 
371 aa  208  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  37.91 
 
 
366 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  38.42 
 
 
426 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  42.71 
 
 
368 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  36.72 
 
 
367 aa  207  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  37.64 
 
 
370 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  35.24 
 
 
421 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  42.51 
 
 
370 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  37.85 
 
 
373 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  36.76 
 
 
378 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  37.8 
 
 
405 aa  206  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  41.59 
 
 
401 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  42.51 
 
 
368 aa  206  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  40.51 
 
 
372 aa  206  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  41 
 
 
366 aa  205  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  37.6 
 
 
370 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  37.94 
 
 
380 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  41.55 
 
 
368 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  39.66 
 
 
368 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  38.55 
 
 
386 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  35.96 
 
 
367 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  36.44 
 
 
371 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  41.45 
 
 
379 aa  203  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 
368 aa  203  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  37.11 
 
 
388 aa  202  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  37.99 
 
 
353 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  39.52 
 
 
373 aa  202  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  43.37 
 
 
366 aa  202  8e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  42.34 
 
 
381 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  41.97 
 
 
381 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  39.66 
 
 
365 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  38.66 
 
 
364 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  43.21 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  43.21 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  43.21 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  38.33 
 
 
370 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.921865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0316  rod shape-determining protein RodA  38.28 
 
 
366 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  39.67 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  38.53 
 
 
366 aa  199  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 
371 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  35.85 
 
 
371 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  41.81 
 
 
380 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>