More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1169 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  354  2.9999999999999997e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 178 aa  218  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  59.78 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 182 aa  210  9e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  59.78 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  57.63 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  58.99 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  58.99 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  58.76 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 178 aa  205  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  58.89 
 
 		 180 aa  204  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  204  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.67 
 
 		 178 aa  202  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  57.3 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  56 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 178 aa  202  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 178 aa  201  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 178 aa  201  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 		 182 aa  201  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 187 aa  201  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  201  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  53.93 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 180 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 181 aa  198  3e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 178 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 178 aa  197  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 178 aa  197  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  52.54 
 
 		 180 aa  197  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 180 aa  197  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  57.14 
 
 		 177 aa  197  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 178 aa  197  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 178 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 178 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  56.22 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  52.72 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 180 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  53.26 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  55.68 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  53.67 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  56 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 178 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  56 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  56.57 
 
 		 177 aa  194  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 180 aa  193  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  56.57 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  56.57 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  51.38 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  53.71 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  191  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  191  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  56.57 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  56.57 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  56.57 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  57.65 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 182 aa  191  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 180 aa  190  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>