278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1166 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  100 
 
 
60 aa  122  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  60 
 
 
75 aa  73.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  56.67 
 
 
60 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  56.67 
 
 
60 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  55 
 
 
60 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  58.18 
 
 
61 aa  67.8  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  60.38 
 
 
62 aa  67.8  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  62.26 
 
 
61 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  60.38 
 
 
62 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  58.18 
 
 
59 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  63.46 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
61 aa  64.3  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  55 
 
 
61 aa  63.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  59.26 
 
 
59 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  59.62 
 
 
60 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  59.62 
 
 
60 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  59.62 
 
 
60 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  59.62 
 
 
60 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  56.36 
 
 
62 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  59.62 
 
 
60 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  59.62 
 
 
60 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  59.62 
 
 
60 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  59.26 
 
 
61 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  59.62 
 
 
60 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  56.67 
 
 
59 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  56.67 
 
 
59 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  59.62 
 
 
60 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  58.93 
 
 
60 aa  60.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  57.69 
 
 
60 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  55 
 
 
60 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  57.41 
 
 
59 aa  60.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  53.33 
 
 
60 aa  60.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  57.41 
 
 
61 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  57.69 
 
 
60 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1244  50S ribosomal protein L30P  51.85 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186097  hitchhiker  0.00279952 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  58.82 
 
 
67 aa  58.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 
59 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  58.82 
 
 
67 aa  58.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 
60 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  55.56 
 
 
60 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  51.67 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  51.85 
 
 
61 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  50.91 
 
 
60 aa  57.8  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  55.56 
 
 
60 aa  57.4  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  52.73 
 
 
58 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  52.73 
 
 
60 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 
60 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  50 
 
 
62 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  51.85 
 
 
60 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 
58 aa  57  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  57.14 
 
 
59 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 
61 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 
59 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 
58 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  50 
 
 
60 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
60 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 
60 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 
60 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  54.55 
 
 
59 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 
60 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 
59 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  54.72 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 
60 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  50.91 
 
 
59 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  50 
 
 
60 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
60 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  53.85 
 
 
64 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 
60 aa  54.3  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 
65 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  49.09 
 
 
58 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  50 
 
 
61 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  46 
 
 
58 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 
62 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
62 aa  52.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  52.73 
 
 
62 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  46.55 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0772  ribosomal protein L30  44.64 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0476  50S ribosomal protein L30P  49.06 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 
59 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  45 
 
 
60 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  53.33 
 
 
57 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 
59 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  48.08 
 
 
58 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 
58 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0785  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
61 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00447996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 
59 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
57 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
57 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 
60 aa  51.2  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 
59 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>