More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1164 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 
431 aa  851    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  52.26 
 
 
420 aa  465  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  53.61 
 
 
435 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  54.18 
 
 
429 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  51.15 
 
 
435 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  55.24 
 
 
419 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  51.42 
 
 
424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  55.48 
 
 
419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  53.68 
 
 
421 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  50.7 
 
 
435 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  49.53 
 
 
435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  50.7 
 
 
437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  53.46 
 
 
445 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  49.3 
 
 
435 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  50.23 
 
 
435 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  52.72 
 
 
447 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  52.86 
 
 
419 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  52.69 
 
 
441 aa  435  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  52.72 
 
 
447 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  52.48 
 
 
447 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  51.66 
 
 
421 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  49.66 
 
 
435 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  50.12 
 
 
418 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  49.77 
 
 
435 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  49.52 
 
 
442 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  51.28 
 
 
440 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  51.62 
 
 
443 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  48.13 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  48.7 
 
 
419 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  51.03 
 
 
442 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  46.45 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  48 
 
 
437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  48.82 
 
 
443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  49.76 
 
 
437 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  48.58 
 
 
443 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  47.28 
 
 
422 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  47.03 
 
 
448 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  48.48 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  49.19 
 
 
443 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  48.58 
 
 
443 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.65 
 
 
463 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  49.19 
 
 
443 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  49.02 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  48.58 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  47.87 
 
 
440 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  46.56 
 
 
437 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  46.64 
 
 
444 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  46.64 
 
 
444 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1834  preprotein translocase subunit SecY  48.27 
 
 
442 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00171083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  44.5 
 
 
435 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  45.79 
 
 
443 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  49.77 
 
 
437 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 
440 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  47.82 
 
 
446 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  48.69 
 
 
445 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0357  preprotein translocase subunit SecY  48.27 
 
 
442 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000838517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  48.39 
 
 
446 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  47.64 
 
 
446 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  46.74 
 
 
443 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  46.87 
 
 
441 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  46.31 
 
 
441 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0073  preprotein translocase, SecY subunit  50 
 
 
445 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.867918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3159  preprotein translocase subunit SecY  49.65 
 
 
447 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  46.39 
 
 
442 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  47.41 
 
 
446 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  46.85 
 
 
430 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  49.64 
 
 
443 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3297  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 
447 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  46.74 
 
 
443 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  47.92 
 
 
428 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  46.09 
 
 
441 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  46.26 
 
 
446 aa  393  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  46.74 
 
 
443 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  47.65 
 
 
446 aa  395  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  49.65 
 
 
444 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  47.89 
 
 
446 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  47.09 
 
 
442 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  46.51 
 
 
443 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  48.06 
 
 
444 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  48.83 
 
 
443 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  45.77 
 
 
432 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  47.67 
 
 
453 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  45.56 
 
 
443 aa  391  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  46.57 
 
 
437 aa  391  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  48.29 
 
 
444 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  48.52 
 
 
436 aa  391  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  48.65 
 
 
436 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  46.47 
 
 
443 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  47.5 
 
 
441 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  48.52 
 
 
444 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  48.59 
 
 
434 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  47.29 
 
 
439 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  46.37 
 
 
437 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  48.93 
 
 
445 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  47.09 
 
 
442 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  48.88 
 
 
436 aa  391  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  48.27 
 
 
446 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  48.39 
 
 
446 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  48.83 
 
 
443 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2930  preprotein translocase subunit SecY  49.09 
 
 
440 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000799077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>