More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0963 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 
457 aa  916    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  36.38 
 
 
453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  39.3 
 
 
457 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  35.14 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  33.33 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  35.48 
 
 
453 aa  280  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  31.87 
 
 
458 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.99 
 
 
455 aa  276  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  32.38 
 
 
458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  32.38 
 
 
458 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  32.38 
 
 
458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  32.16 
 
 
454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  34.73 
 
 
457 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  32.16 
 
 
458 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  32.16 
 
 
454 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  36.75 
 
 
457 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  31.94 
 
 
458 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  32.61 
 
 
468 aa  270  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  32.16 
 
 
458 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  32.16 
 
 
458 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  36.84 
 
 
436 aa  269  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  36.14 
 
 
460 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  34.2 
 
 
451 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  36.03 
 
 
454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  32.48 
 
 
448 aa  265  8.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  34.78 
 
 
461 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  34.78 
 
 
461 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  33.62 
 
 
455 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.62 
 
 
455 aa  259  9e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  32.89 
 
 
459 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  37.37 
 
 
473 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  34.87 
 
 
455 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  34.77 
 
 
460 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  35.63 
 
 
397 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  32.31 
 
 
456 aa  246  9e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  30.8 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  30.17 
 
 
458 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  30.7 
 
 
453 aa  243  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  30.7 
 
 
453 aa  243  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  37.58 
 
 
465 aa  242  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  34.6 
 
 
419 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  30.79 
 
 
454 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  33.71 
 
 
405 aa  236  8e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  30.85 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  33.54 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.45 
 
 
485 aa  233  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  35.36 
 
 
468 aa  231  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  31.02 
 
 
452 aa  229  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  33.05 
 
 
471 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  33.12 
 
 
446 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  32.02 
 
 
488 aa  227  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  32.03 
 
 
460 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  35.17 
 
 
466 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.91 
 
 
456 aa  223  7e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  33.62 
 
 
469 aa  222  9e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  30.15 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  28.48 
 
 
481 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.09 
 
 
477 aa  220  5e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  32.61 
 
 
467 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.78 
 
 
459 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  29.78 
 
 
459 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  29.78 
 
 
459 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.78 
 
 
459 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.78 
 
 
459 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  30.84 
 
 
468 aa  219  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  29.63 
 
 
459 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  29.63 
 
 
459 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  29.71 
 
 
463 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2200  RNA methyltransferase, TrmA family  32.59 
 
 
414 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  28.7 
 
 
458 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  32.75 
 
 
449 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  27.65 
 
 
473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  30.57 
 
 
450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  32.36 
 
 
459 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  29.89 
 
 
459 aa  216  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  29.88 
 
 
480 aa  216  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  31.63 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  28.94 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  31.73 
 
 
482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  29.74 
 
 
470 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.32 
 
 
465 aa  209  9e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  33.62 
 
 
495 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  34.05 
 
 
456 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  28.03 
 
 
479 aa  206  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1248  RNA methyltransferase, TrmA family  33.26 
 
 
461 aa  206  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06020  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.65 
 
 
444 aa  205  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.14779  hitchhiker  0.000000000313227 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  29.5 
 
 
446 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.8 
 
 
462 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  27.08 
 
 
470 aa  204  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  29.36 
 
 
478 aa  204  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  30.62 
 
 
458 aa  204  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  31.87 
 
 
488 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  28.99 
 
 
476 aa  204  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  29.32 
 
 
465 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  27.56 
 
 
419 aa  203  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  29.85 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  34.73 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  30.18 
 
 
489 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  27.72 
 
 
471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.42 
 
 
493 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>