More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0848 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  54.35 
 
 
644 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.24 
 
 
647 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  58.76 
 
 
693 aa  686    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  58.05 
 
 
614 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.61 
 
 
637 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.34 
 
 
642 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  54.79 
 
 
638 aa  666    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.29 
 
 
617 aa  680    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  57.96 
 
 
633 aa  689    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.26 
 
 
660 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  54.35 
 
 
644 aa  641    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  53.91 
 
 
647 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  55.37 
 
 
634 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  57.96 
 
 
633 aa  690    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  57.96 
 
 
633 aa  690    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  57.96 
 
 
633 aa  690    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.72 
 
 
634 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.56 
 
 
634 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  54.24 
 
 
647 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  55.22 
 
 
634 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  53.43 
 
 
626 aa  668    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  57.05 
 
 
682 aa  646    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  54.14 
 
 
638 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.64 
 
 
633 aa  685    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.34 
 
 
640 aa  670    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.56 
 
 
634 aa  659    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.44 
 
 
630 aa  659    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  55.46 
 
 
640 aa  657    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  55.43 
 
 
613 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  54.85 
 
 
644 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  54.06 
 
 
641 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.05 
 
 
635 aa  663    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  56.91 
 
 
616 aa  701    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  54.75 
 
 
617 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.03 
 
 
614 aa  690    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  54.08 
 
 
764 aa  650    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  54.24 
 
 
647 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.09 
 
 
634 aa  660    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  57.49 
 
 
608 aa  716    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  56.73 
 
 
665 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.37 
 
 
615 aa  713    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  57.96 
 
 
633 aa  690    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  54.41 
 
 
617 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  56.93 
 
 
613 aa  661    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.02 
 
 
611 aa  705    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.32 
 
 
631 aa  664    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.4 
 
 
640 aa  689    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  62.33 
 
 
645 aa  727    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  54.01 
 
 
644 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  55.91 
 
 
635 aa  661    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.7 
 
 
645 aa  644    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.13 
 
 
638 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  52.37 
 
 
651 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.78 
 
 
635 aa  655    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.62 
 
 
638 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.08 
 
 
631 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.87 
 
 
613 aa  648    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.86 
 
 
610 aa  711    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  53.68 
 
 
643 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.3 
 
 
638 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  56.27 
 
 
642 aa  658    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.9 
 
 
638 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.19 
 
 
645 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  54.18 
 
 
658 aa  635    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  55.89 
 
 
637 aa  659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  54.37 
 
 
649 aa  642    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.36 
 
 
640 aa  653    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.3 
 
 
651 aa  640    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  56.89 
 
 
627 aa  681    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  53.74 
 
 
647 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.16 
 
 
645 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  54.35 
 
 
644 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.72 
 
 
634 aa  652    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.86 
 
 
610 aa  710    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  55.37 
 
 
613 aa  636    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.8 
 
 
639 aa  690    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.52 
 
 
651 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  53.58 
 
 
639 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  54.24 
 
 
647 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.48 
 
 
599 aa  688    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  54.19 
 
 
617 aa  640    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  56.38 
 
 
639 aa  656    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.52 
 
 
652 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.34 
 
 
642 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.45 
 
 
652 aa  695    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.19 
 
 
647 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.21 
 
 
640 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.48 
 
 
673 aa  692    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.08 
 
 
641 aa  646    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  56.83 
 
 
654 aa  644    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.22 
 
 
621 aa  690    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.9 
 
 
646 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.12 
 
 
617 aa  682    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.41 
 
 
640 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.95 
 
 
620 aa  697    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.7 
 
 
647 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.51 
 
 
656 aa  680    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  53.33 
 
 
641 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.14 
 
 
640 aa  677    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.96 
 
 
640 aa  677    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>