174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0754 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0754  Radical SAM domain protein  100 
 
 
319 aa  642    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  33.86 
 
 
311 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  33.9 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  37.22 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  32.36 
 
 
309 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  36.58 
 
 
372 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  33.44 
 
 
306 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  31.61 
 
 
316 aa  158  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  35.06 
 
 
310 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  33 
 
 
312 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  35.29 
 
 
305 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  155  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  32.04 
 
 
309 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  30.82 
 
 
313 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3422  putative radical SAM protein  30.65 
 
 
319 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  32.04 
 
 
309 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  31.82 
 
 
319 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  31.82 
 
 
319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  32.47 
 
 
319 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  31.82 
 
 
319 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  31.72 
 
 
309 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  31.72 
 
 
309 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  31.82 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  31.72 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  31.72 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.672413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  32.04 
 
 
309 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  32.04 
 
 
309 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  31.82 
 
 
319 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  31.82 
 
 
319 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  32.04 
 
 
309 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  31.49 
 
 
319 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  32.04 
 
 
309 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  32.04 
 
 
309 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  32.04 
 
 
309 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  32.04 
 
 
320 aa  152  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  32.04 
 
 
309 aa  152  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4499  Fe-S oxidoreductase  31.49 
 
 
319 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  32.79 
 
 
328 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  31.49 
 
 
319 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  32.14 
 
 
314 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  36.33 
 
 
351 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2769  hypothetical protein  29.6 
 
 
320 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0254774  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0408  putative radical SAM protein  28.94 
 
 
313 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4892  hypothetical protein  31.17 
 
 
319 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  30.62 
 
 
314 aa  149  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  32.87 
 
 
314 aa  149  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  34.11 
 
 
311 aa  149  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  33.22 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0370  putative radical SAM protein  31.37 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1815  hypothetical protein  31.07 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.501711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1850  hypothetical protein  31.07 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013981  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  31.46 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  28.01 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  31.46 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1320  hypothetical protein  27.96 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  33.56 
 
 
317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  29.47 
 
 
311 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  29.47 
 
 
311 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  32.13 
 
 
309 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  33.09 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  33.12 
 
 
318 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  33.45 
 
 
317 aa  145  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  33.55 
 
 
319 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  31.51 
 
 
322 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  34.56 
 
 
330 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  31.46 
 
 
327 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  29.87 
 
 
316 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  32.27 
 
 
309 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  32.13 
 
 
312 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  32.18 
 
 
319 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  31.91 
 
 
309 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  32.79 
 
 
318 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  31.56 
 
 
309 aa  142  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  31.91 
 
 
309 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  32.79 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1223  putative radical SAM protein  32.75 
 
 
309 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784754  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  28.57 
 
 
307 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  31.13 
 
 
564 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  29.69 
 
 
319 aa  139  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1256  putative radical SAM protein  32.27 
 
 
309 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0785555  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  32.04 
 
 
309 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  31.69 
 
 
309 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  32.04 
 
 
309 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  27.12 
 
 
318 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  33.65 
 
 
319 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  33.99 
 
 
321 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3853  hypothetical protein  32.45 
 
 
311 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000731814 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  27.61 
 
 
334 aa  136  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  27 
 
 
332 aa  136  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  32.37 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  29.85 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1611  radical SAM superfamily protein  29.87 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.586759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  30.28 
 
 
317 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4119  putative radical SAM protein  31.79 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155927  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  26.33 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0609  putative radical SAM protein  33.02 
 
 
331 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.165086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  27.06 
 
 
325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  26.83 
 
 
341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  28.93 
 
 
303 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>