280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0725 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  131  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  72  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  55.38 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 
64 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  54.24 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  48.44 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0347  ribosomal protein L35  46.15 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040469  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  43.75 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  45.16 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  46.88 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 
63 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  42.19 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  48.44 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  50.82 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  55.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  55.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  44.44 
 
 
63 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  43.55 
 
 
66 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  43.55 
 
 
64 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 
65 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
64 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  41.94 
 
 
64 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  52 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>