More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0551 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 219 aa  448  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  37.81 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 293 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  35.58 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 242 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 239 aa  99.4  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  32.06 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 260 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.96 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 226 aa  94.7  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 252 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.28 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 247 aa  92.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 246 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 240 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 240 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  34.48 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 266 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 257 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  32.42 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 262 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  33.96 
 
 		 250 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  34.76 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 265 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 255 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>