More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0538 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  100 
 
 
159 aa  323  8.000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  36.36 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.19 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.03 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.72 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  27.78 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  31.17 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  27.08 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  28.48 
 
 
515 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  27.08 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.45 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  36.99 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  30 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  29.03 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  30 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  33.56 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  30.14 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.69 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  27.33 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  26.71 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  27.33 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  32.37 
 
 
280 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  30.52 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  24.32 
 
 
162 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  32.65 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  28.86 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  28.66 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  31.29 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  29.37 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  30.86 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  30 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  28.85 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  29.73 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 
297 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.92 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  28.97 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  28 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  29.29 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  28.85 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  29.8 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  29.8 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  29.8 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  29.8 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  29.8 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  33.56 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  30.82 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  28.28 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  29.8 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  29.8 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  29.8 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  29.8 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.62 
 
 
290 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.87 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  31.54 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 
148 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  28.1 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  29.45 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  29.53 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.45 
 
 
141 aa  62.4  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.72 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  28.1 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  30.52 
 
 
173 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  28.67 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  28.87 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  37.33 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
166 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
166 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  37.33 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  29.14 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  32.41 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  26.14 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  31.09 
 
 
296 aa  60.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
157 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  28.29 
 
 
154 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
155 aa  60.5  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.97 
 
 
149 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  29.53 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  30.41 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.9 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  27.59 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>