64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0477 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 
434 aa  846    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  55.45 
 
 
433 aa  462  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  52.07 
 
 
432 aa  449  1e-125  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  53.41 
 
 
455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  55.5 
 
 
435 aa  436  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  55.16 
 
 
455 aa  419  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  49.42 
 
 
433 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  48.73 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  47.62 
 
 
442 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  49.53 
 
 
425 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  48.85 
 
 
431 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  48.96 
 
 
433 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  48.65 
 
 
446 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  45.81 
 
 
446 aa  374  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  43.86 
 
 
439 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  48.53 
 
 
441 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  44.79 
 
 
452 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  43.18 
 
 
439 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  46.14 
 
 
440 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  46.26 
 
 
439 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  42.95 
 
 
439 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  46.03 
 
 
439 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  42.5 
 
 
439 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  42.92 
 
 
439 aa  363  3e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  42.5 
 
 
439 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  44.22 
 
 
439 aa  363  4e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  43.31 
 
 
439 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  45.8 
 
 
439 aa  362  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  46.03 
 
 
439 aa  362  9e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  43.08 
 
 
439 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  44.34 
 
 
440 aa  361  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  42.86 
 
 
439 aa  360  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  42.86 
 
 
439 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  42.63 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  45.56 
 
 
448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  44.44 
 
 
439 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  44.44 
 
 
439 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  44.44 
 
 
439 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  44.44 
 
 
439 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  45.23 
 
 
439 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  44.18 
 
 
453 aa  350  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  48.53 
 
 
440 aa  348  1e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  43.47 
 
 
445 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  43.78 
 
 
450 aa  343  2e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  44.32 
 
 
439 aa  344  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  45.23 
 
 
439 aa  343  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  41.27 
 
 
438 aa  340  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  43.92 
 
 
442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  41.27 
 
 
438 aa  340  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  41.27 
 
 
438 aa  340  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  44.77 
 
 
439 aa  339  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  46.71 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  42.37 
 
 
464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  46.26 
 
 
441 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  45.56 
 
 
439 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  45.33 
 
 
438 aa  316  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  44.02 
 
 
439 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  44.02 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  44.65 
 
 
439 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  44.47 
 
 
439 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  38.98 
 
 
448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  36.84 
 
 
438 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2593  gluconate permease  23.66 
 
 
421 aa  47  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  26.85 
 
 
517 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>