More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0461 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0461  Patatin  100 
 
 
707 aa  1415    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.86 
 
 
728 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  31.12 
 
 
728 aa  207  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  37.67 
 
 
751 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  38.62 
 
 
727 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  39.07 
 
 
728 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  38.79 
 
 
728 aa  204  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  38.68 
 
 
728 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  36.41 
 
 
733 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.27 
 
 
760 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  42.52 
 
 
777 aa  188  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  36.39 
 
 
767 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  33.74 
 
 
667 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  38.13 
 
 
750 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  41.24 
 
 
790 aa  179  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  35.48 
 
 
933 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  35.48 
 
 
945 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  32.37 
 
 
796 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  35.48 
 
 
728 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  35 
 
 
920 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  35 
 
 
930 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  41.06 
 
 
804 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  41.06 
 
 
803 aa  171  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  36.08 
 
 
798 aa  171  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  41.06 
 
 
803 aa  171  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  41.06 
 
 
803 aa  171  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  28.54 
 
 
740 aa  170  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  43.97 
 
 
753 aa  170  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  38.54 
 
 
745 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  34.86 
 
 
741 aa  169  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  35.04 
 
 
714 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  38.89 
 
 
852 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  36.78 
 
 
738 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  36.53 
 
 
813 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  38.81 
 
 
333 aa  161  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  38.81 
 
 
320 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  38.57 
 
 
735 aa  160  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  38.81 
 
 
320 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  37.82 
 
 
253 aa  160  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  38.38 
 
 
311 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  40.07 
 
 
320 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  36.91 
 
 
720 aa  158  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  35.46 
 
 
751 aa  157  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  25.47 
 
 
738 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  27.33 
 
 
738 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  27.33 
 
 
737 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  27.12 
 
 
738 aa  154  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  33.23 
 
 
739 aa  153  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  33.44 
 
 
738 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  33.44 
 
 
738 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  35.44 
 
 
734 aa  151  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  33.11 
 
 
754 aa  150  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  34.05 
 
 
260 aa  150  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  30.73 
 
 
733 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  32.81 
 
 
738 aa  148  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  32.07 
 
 
740 aa  148  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  32.9 
 
 
737 aa  147  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  26.96 
 
 
745 aa  147  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  32.22 
 
 
746 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  24.49 
 
 
736 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  34.21 
 
 
981 aa  147  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  34.55 
 
 
263 aa  146  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  30.66 
 
 
748 aa  143  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  36.05 
 
 
909 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  37.55 
 
 
273 aa  142  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  36 
 
 
256 aa  141  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  36.33 
 
 
272 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  26.12 
 
 
735 aa  140  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  35.37 
 
 
771 aa  140  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  35.29 
 
 
923 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  35 
 
 
263 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  35.85 
 
 
737 aa  139  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  34.64 
 
 
263 aa  138  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  36.11 
 
 
950 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  34.64 
 
 
263 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.29 
 
 
263 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.29 
 
 
263 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  33.52 
 
 
875 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  36.69 
 
 
324 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  33.93 
 
 
263 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  33.93 
 
 
263 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  33.93 
 
 
263 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  33.93 
 
 
263 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  33.57 
 
 
263 aa  134  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  36 
 
 
262 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  35.21 
 
 
894 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  30.72 
 
 
310 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  32.85 
 
 
323 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  37.25 
 
 
303 aa  130  8.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  32.09 
 
 
301 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  33.22 
 
 
776 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  34.53 
 
 
764 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  31.27 
 
 
318 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.05 
 
 
302 aa  125  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  31.29 
 
 
318 aa  124  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  31.36 
 
 
252 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  30.95 
 
 
335 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  23.98 
 
 
775 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  33.81 
 
 
318 aa  122  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  32.55 
 
 
319 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>