More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0436 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0436  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 229 aa  449  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000632498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.29 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.36 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.36 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.13 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.5 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.03 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.92 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  27.51 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.47 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  32.16 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  34.3 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  27.51 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.24 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  28.99 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.98 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.98 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.86 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  26.98 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.88 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  27.37 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  32.75 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  26.46 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  26.46 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  26.46 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.41 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.06 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  26.98 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  27.37 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.37 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.75 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  25.4 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.74 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.33 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.74 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  26.9 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  27.01 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  26.84 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  28.07 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  24.87 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  24.87 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  24.87 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.29 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  24.87 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  24.87 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  28.27 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  24.87 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  28.8 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  24.87 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  24.87 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  24.87 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.75 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  24.87 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.06 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  23.81 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.68 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.14 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.52 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.98 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>