89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0242 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 
484 aa  973    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  45.08 
 
 
579 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  42.41 
 
 
583 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  35.21 
 
 
567 aa  223  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  34.6 
 
 
444 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  28.76 
 
 
374 aa  139  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  30.9 
 
 
542 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  26.53 
 
 
316 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  26.67 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  31.75 
 
 
358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  29.6 
 
 
349 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  28.72 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  26.96 
 
 
426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  29.13 
 
 
356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 
793 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 
307 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.58 
 
 
1115 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  25 
 
 
415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  26.67 
 
 
343 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  23.29 
 
 
433 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  27.57 
 
 
688 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.57 
 
 
1115 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 
427 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  30.83 
 
 
580 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  28.62 
 
 
428 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  31.01 
 
 
329 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  28.23 
 
 
428 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  27 
 
 
503 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26 
 
 
470 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.57 
 
 
1119 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  28.57 
 
 
420 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 
430 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 
430 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  26.02 
 
 
430 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  26.02 
 
 
430 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  26.02 
 
 
430 aa  100  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.23 
 
 
1115 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  25.61 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  25.61 
 
 
430 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  25.61 
 
 
430 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  25.61 
 
 
430 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  25.61 
 
 
430 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  31.08 
 
 
451 aa  95.9  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 
418 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.56 
 
 
1115 aa  93.6  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 
1101 aa  93.2  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  25.5 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  24.3 
 
 
312 aa  91.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.7 
 
 
927 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  25.16 
 
 
390 aa  91.3  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  27.37 
 
 
647 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 
1154 aa  87  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 
1118 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  29.61 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  27.75 
 
 
521 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  22.61 
 
 
1124 aa  73.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  24.09 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  27.78 
 
 
342 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  21.88 
 
 
1120 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  29.52 
 
 
382 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  30.25 
 
 
426 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  25.11 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  22.37 
 
 
1002 aa  56.6  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  21.34 
 
 
674 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  20.95 
 
 
418 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  21.34 
 
 
674 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  21.77 
 
 
674 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  21.37 
 
 
674 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  21.37 
 
 
674 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  21.37 
 
 
674 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  21.28 
 
 
872 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  21.37 
 
 
674 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  21.37 
 
 
674 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  21.37 
 
 
674 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  20.95 
 
 
674 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  24.48 
 
 
364 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  23.89 
 
 
1782 aa  50.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  25.42 
 
 
1271 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  24.11 
 
 
377 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1379  glycosyl hydrolase-like protein  34 
 
 
330 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  22.32 
 
 
388 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  20.55 
 
 
674 aa  47  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3919  chitinase II  22.18 
 
 
695 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00105192  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  24.86 
 
 
536 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  22.17 
 
 
431 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  30.12 
 
 
396 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  27.21 
 
 
801 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>