226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0100 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 
270 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.63 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  33.62 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 
245 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  33.77 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  33.33 
 
 
243 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  29.91 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.05 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
232 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  28.18 
 
 
247 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
245 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.7 
 
 
251 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
251 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.9 
 
 
265 aa  85.1  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
286 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  27.68 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  27.68 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  27.68 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  27.68 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  26.55 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  26.16 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  25.74 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.86 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  26.36 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  28.12 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  24.68 
 
 
274 aa  79  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  25.45 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  26.16 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  27.23 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.07 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  25.97 
 
 
248 aa  72  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.48 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
253 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  29.84 
 
 
253 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  24.07 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
322 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 
245 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  21.19 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0340  peptidoglycan-binding LysM  22.58 
 
 
359 aa  59.3  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0341  hypothetical protein  25.21 
 
 
357 aa  59.3  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4365  hypothetical protein  21.58 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.51 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0527  hypothetical protein  25.76 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.3 
 
 
492 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  25.95 
 
 
1301 aa  55.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  23.73 
 
 
303 aa  55.1  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4230  hypothetical protein  19.67 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5716  hypothetical protein  27.64 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  23.26 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65870  hypothetical protein  27.64 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  25.33 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  25 
 
 
727 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.9 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1185  extracellular solute-binding protein family 3  24.51 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148046 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  24.79 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.72 
 
 
253 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  26.41 
 
 
598 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  23.26 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2837  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117714  normal  0.871916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
604 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  26.02 
 
 
596 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  22.62 
 
 
250 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4360  hypothetical protein  25.24 
 
 
264 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.519402  hitchhiker  0.0094359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0187  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.056665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  28.16 
 
 
830 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
263 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3522  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.11 
 
 
276 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.389292 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  25.89 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0683  extracellular solute-binding protein  37.66 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.732102  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.8 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  23.2 
 
 
293 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  24.07 
 
 
736 aa  48.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  25 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  23.77 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2109  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  24.71 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  23.55 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.47 
 
 
493 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3223  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding  23.56 
 
 
255 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.87 
 
 
258 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>