172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0073 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0073  microcompartments protein  100 
 
 		 175 aa  339  1e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1359  microcompartments protein  29.15 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  44.44 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  43.53 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0894  ethanolamine utilization protein  48.84 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1182  microcompartments protein  52.38 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  45.88 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3280  carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein-like  30.35 
 
 		 207 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3278  microcompartment protein  48.86 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2641  microcompartments protein  46.67 
 
 		 96 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4893  microcompartments protein  35.91 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0896  ethanolamine utilization protein EutM  47.73 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1299  microcompartments protein  46.59 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0075  microcompartments protein  43.3 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4907  microcompartments protein  39.08 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1368  microcompartments protein  50 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0905  microcompartments protein  44.71 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0357  microcompartments protein  47.87 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3270  ethanolamine utilization protein eutM precursor  50.59 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4097  microcompartments protein  47.06 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1290  microcompartments protein  43.53 
 
 		 90 aa  67  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0908  microcompartments protein  43.96 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1168  microcompartments protein  42.86 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1430  microcompartments protein  50 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0758  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  45.05 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.531252  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3264  microcompartments protein  44.32 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4890  microcompartments protein  45.45 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0358  microcompartments protein  47.06 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1038  microcompartments protein  46.43 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1615  carboxysome shell peptide, CsoS1  44.21 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0557247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0751  carboxysome shell peptide, CsoS1  44.21 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08071  carboxysome shell protein CsoS1  44.21 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0501  putative carboxysome structural-like protein  47.62 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05511  carboxysome shell protein CsoS1  44.21 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05581  hypothetical protein  45.05 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  44.21 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4030  microcompartments protein  45.45 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  44.21 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1039  microcompartments protein  44.32 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0549  carboxysome shell protein CsoS1  44.21 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06051  carboxysome shell protein CsoS1  44.21 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0748449  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05751  carboxysome shell protein CsoS1  44.21 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06131  carboxysome shell protein CsoS1  44.21 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.172754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  37.65 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1755  microcompartments protein  44.3 
 
 		 89 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1411  microcompartments protein  46.43 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1955  microcompartments protein  45.98 
 
 		 93 aa  63.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0844  microcompartments protein  47.13 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.605496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0845  microcompartments protein  47.13 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0846  microcompartments protein  47.13 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.705966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  45.24 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1043  microcompartments protein  44.71 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2215  propanediol utilization protein PduJ  45.35 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1608  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  44.57 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2381  propanediol utilization protein PduJ  45.35 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2222  propanediol utilization protein PduJ  45.35 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.68551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2268  propanediol utilization protein PduJ  45.35 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.0436831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2168  propanediol utilization protein PduJ  45.35 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2644  carboxysome structural peptide CsoS1B  45.05 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0865  microcompartments protein  43.01 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0916  microcompartments protein  46.59 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2646  carboxysome shell protein, CsoS1C  44.09 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0915  microcompartments protein  46.59 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0864  microcompartments protein  44.57 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.465845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2645  carboxysome shell protein CsoS1A  45.45 
 
 		 101 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4908  microcompartments protein  40.23 
 
 		 98 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1383  microcompartments protein  46.59 
 
 		 98 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0866  microcompartments protein  43.01 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.457489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2647  major carboxysome shell protein 1C (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  40.86 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2338  microcompartments protein  43.48 
 
 		 101 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000912502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3195  carboxysome structural peptide CsoS1B  43.01 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1685  carboxysome shell peptide  46.59 
 
 		 98 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0523027  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1683  carboxysome shell peptide  45.45 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373595  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1885  carboxysome shell peptide, CsoS1  42.53 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0124  microcompartments protein  45.45 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0125  microcompartments protein  45.45 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06101  carboxysome structural protein CsoS1  42.53 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.33467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2345  microcompartments protein  43.48 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000506972  hitchhiker  0.00332823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  45.45 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1427  microcompartments protein  45 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.295339  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0126  microcompartments protein  45.45 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1382  microcompartments protein  45.45 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1381  microcompartments protein  45.45 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3197  carboxysome shell protein, CsoS1C  41.94 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4339  carboxysome structural peptide CsoS1B  42.71 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2374  propanediol utilization protein PduA  44.05 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3267  microcompartments protein  42.34 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.820154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3196  carboxysome structural peptide CsoS1B  41.94 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.446917  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2215  propanediol utilization protein PduA  44.05 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2161  propanediol utilization protein PduA  44.05 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2261  propanediol utilization protein PduA  44.05 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.558848  normal  0.158414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2208  propanediol utilization protein PduA  44.05 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2279  propanediol utilization protein PduA  42.35 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176891  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2286  propanediol utilization protein PduJ  44.19 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1980  carboxysome structural peptide CsoS1B  41.94 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08151  hypothetical protein  43.9 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1981  carboxysome structural polypeptide  44.83 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4338  carboxysome structural polypeptide  44.83 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  40.7 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0914  microcompartments protein  43.82 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>