26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0072 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0072  microcompartments protein  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1056  microcompartments protein  74.88 
 
 
217 aa  334  7.999999999999999e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2644  microcompartments protein  74.77 
 
 
218 aa  329  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0893  ethanolamine utilization protein EutL  72.35 
 
 
217 aa  302  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1298  microcompartments protein  64.52 
 
 
217 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1242  microcompartments protein  60.38 
 
 
218 aa  274  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4864  microcompartments protein  60.28 
 
 
215 aa  259  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1222  microcompartments protein  55.66 
 
 
219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2594  putative ethanolamine utilization protein EutL  54.72 
 
 
219 aa  238  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3669  putative ethanolamine utilization protein EutL  55.19 
 
 
219 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1240  microcompartments protein  54.72 
 
 
219 aa  238  8e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.407797  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2811  putative ethanolamine utilization protein EutL  54.72 
 
 
219 aa  238  8e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2725  putative ethanolamine utilization protein EutL  54.72 
 
 
219 aa  238  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2576  putative ethanolamine utilization protein EutL  54.72 
 
 
219 aa  238  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02339  predicted carboxysome structural protein with predicted role in ethanolamine utilization  54.72 
 
 
219 aa  237  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02301  hypothetical protein  54.72 
 
 
219 aa  237  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2601  putative ethanolamine utilization protein EutL  54.25 
 
 
219 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2823  putative ethanolamine utilization protein EutL  54.25 
 
 
219 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2716  ethanolamine utilization protein EutL  54.25 
 
 
219 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.823551  normal  0.898819 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2649  putative ethanolamine utilization protein EutL  54.25 
 
 
219 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2690  ethanolamine utilization protein EutL  54.25 
 
 
219 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0908127  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4032  microcompartments protein  59.72 
 
 
218 aa  232  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2162  propanediol utilization protein PduB  27.87 
 
 
270 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2375  propanediol utilization protein PduB  27.87 
 
 
270 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2262  propanediol utilization protein PduB  27.87 
 
 
270 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.124484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2216  propanediol utilization protein PduB  27.87 
 
 
270 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>