More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0057 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
276 aa  551  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 
335 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  30.11 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  28.1 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  27.34 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  26.28 
 
 
310 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28.85 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  26.69 
 
 
290 aa  130  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 
300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  26.22 
 
 
296 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 
293 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  27.34 
 
 
344 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  25.77 
 
 
290 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 
292 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  25.08 
 
 
310 aa  123  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  26.17 
 
 
311 aa  122  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  25.98 
 
 
290 aa  122  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  29.05 
 
 
294 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  26.62 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  27.41 
 
 
300 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  27.65 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  26.18 
 
 
302 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  24.74 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  24.66 
 
 
299 aa  116  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  24.41 
 
 
302 aa  113  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  28.16 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  24.57 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  24.24 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  23.64 
 
 
318 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  25.94 
 
 
328 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  24.91 
 
 
296 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  29.6 
 
 
307 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  25.84 
 
 
293 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  31.66 
 
 
292 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  25 
 
 
310 aa  105  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  29.74 
 
 
292 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  29.24 
 
 
307 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  23.14 
 
 
368 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  23.31 
 
 
298 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  23.31 
 
 
298 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  23.76 
 
 
313 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 
309 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  26.24 
 
 
312 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  27.85 
 
 
298 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 
292 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  22.18 
 
 
291 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  28.83 
 
 
292 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 
311 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  27.93 
 
 
292 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  21.37 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  30.38 
 
 
298 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  21.77 
 
 
296 aa  99  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  27.98 
 
 
469 aa  99  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  28.82 
 
 
327 aa  98.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.96 
 
 
298 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  27.17 
 
 
347 aa  97.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  34.48 
 
 
345 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  27.9 
 
 
312 aa  96.3  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  23.79 
 
 
315 aa  95.5  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  28.9 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  28.41 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  24.91 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 
301 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  27.71 
 
 
292 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  22.99 
 
 
301 aa  93.2  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  23.27 
 
 
313 aa  92.8  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  27.6 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  24.23 
 
 
278 aa  92.8  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  27.6 
 
 
301 aa  92.4  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  23.47 
 
 
332 aa  92.4  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  24.71 
 
 
278 aa  92.4  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  24.6 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  23.11 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  29.8 
 
 
321 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  24.51 
 
 
287 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  28.63 
 
 
305 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.83 
 
 
349 aa  90.9  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  26.91 
 
 
345 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  27.16 
 
 
321 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  20.88 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0696  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.09 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  26.45 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  24.3 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  22.89 
 
 
316 aa  89  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  21.05 
 
 
280 aa  89.4  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  21.99 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  26.6 
 
 
313 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  26.4 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  27.98 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  25.78 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  28.8 
 
 
304 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  21.13 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  21.13 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 
316 aa  87  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>